RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 SPRED2Q7Z698 418 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 C17orf47Q8NEP4 570 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 PTP4A1Q93096 173 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 MRAP2Q96G30 205 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 MOB4Q9Y3A3 225 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 S4R3C0 116 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 MDKP21741 143 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 KIR3DL2P43630 455 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 CD226Q15762 336 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 RAB37Q96AX2 223 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 C1RLQ9NZP8 487 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 SIRT7Q9NRC8 400 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 STARD10Q9Y365 291 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 PSMB11A5LHX3 300 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 AP4M1O00189 453 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 TGIF1Q15583 401 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 SELENOKQ9Y6D0 94 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 H3BTX0 84 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 BCL2L10Q9HD36 194 aa9.26□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 ATP6V1FQ16864 119 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 RNF212Q495C1 297 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 VN1R17PQ8TDU5 208 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 APCSP02743 223 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 SSTR5P35346 364 aa9.25□□□□□ -0.93
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CLN8-201ENST00000331222 CACNG7P62955 275 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 TMEM255AQ5JRV8 349 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 OR2V2Q96R30 315 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 BET1LQ9NYM9 111 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 RAXQ9Y2V3 346 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 A0A1B0GU03 582 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 IGLV3-25P01717 112 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 CXCL10P02778 98 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 RIGQ13278 110 aa9.25□□□□□ -0.93
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CLN8-201ENST00000331222 C1orf185Q5T7R7 199 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa9.25□□□□□ -0.93
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CLN8-201ENST00000331222 CDC42EP2O14613 210 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 PAGE4O60829 102 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
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CLN8-201ENST00000331222 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 RAB29O14966 203 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 NUDT3O95989 172 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 GPBAR1Q8TDU6 330 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 FRRS1LQ9P0K9 344 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 GTF3C1Q12789 2109 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 J3QR06 171 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 RGS13O14921 159 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 ZNF253O75346 499 aa9.25□□□□□ -0.93
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CLN8-201ENST00000331222 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 ARAP2Q8WZ64 1704 aa9.25□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 GFRA3O60609 400 aa9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 RAC3P60763 192 aa9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 DDB2Q92466 427 aa9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 SEC11CQ9BY50 192 aa9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 TTTY12Q9BZ98 90 aa9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 IGSF23A1L1A6 192 aa9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 HSPB2A8KAH6 182 aa9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 HSPB2Q16082 182 aa9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 PIMREGQ9BSJ6 248 aa9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 SLC35B3Q9H1N7 401 aa9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 GPR35Q9HC97 309 aa9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 IL36RNQ9UBH0 155 aa9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 PRSS50Q9UI38 385 aa9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 NUBPLQ8TB37 319 aa9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 NEU1Q99519 415 aa9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 PRR35P0CG20 571 aa9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 ARF6P62330 175 aa9.24□□□□□ -0.93
CLN8-201ENST00000331222 ZNF826PQ6ZT77 177 aa9.24□□□□□ -0.93
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