RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 RFESDQ8TAC1 157 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC6A7Q99884 636 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTTG1O95997 202 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 USF1P22415 310 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF273Q14593 569 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR6F1Q8NGZ6 308 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 CABLES2Q9BTV7 478 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC23A1Q9UHI7 598 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 C15orf65H3BRN8 121 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 DIRAS3O95661 229 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPIAL4GP0DN37 164 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCF23Q7RTU1 214 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 DPAGT1Q9H3H5 408 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 APCP25054 2843 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 FOXH1O75593 365 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF728P0DKX0 622 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB25P24278 435 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 HERPUD1Q15011 391 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 C8orf46Q8TAG6 207 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2S2Q9NQN1 319 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 NAV2Q8IVL1 2488 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 POLQO75417 2590 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 LIPFP07098 398 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF735P0CB33 412 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 CGB3P0DN86 165 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 CGB7P0DN87 165 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 FCGR2CP31995 323 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 LTC4SQ16873 150 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 C17orf58Q2M2W7 97 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 IDO2Q6ZQW0 420 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 NRARPQ7Z6K4 114 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCL3L1P16619 93 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC6A1P30531 599 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCR6P51684 374 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 LCN2P80188 198 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 HTD2P86397 168 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM16LQ309B1 348 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC2A8Q9NY64 477 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 COPZ2Q9P299 210 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNG12Q9UBI6 72 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF69Q9UC07 566 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 HECTD1Q9ULT8 2610 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 A8MXK9 166 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 C22orf46C9J442 243 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 OMGP23515 440 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 FPR2P25090 351 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 BTCP35070 178 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 HERV-K104P61576 105 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM30BQ3MIR4 351 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 DHRS11Q6UWP2 260 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PPE2 198 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PR64 198 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PRV1 198 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 F2RL2O00254 374 aa22.6■■□□□ 1.21
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CEACAM6P40199 344 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 LY6G5BQ8NDX9 201 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR52L2PQ8NGH6 319 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 TERB2Q8NHR7 220 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 GIMAP1Q8WWP7 306 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC00574Q9H8X3 128 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR1A1Q9P1Q5 309 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 ONECUT1Q9UBC0 465 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 MINDY2Q8NBR6 621 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10A7Q8NGE5 316 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q96MF0 132 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 FOXC2Q99958 501 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 JPT1Q9UK76 154 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 UNC79Q9P2D8 2635 aa22.59■■□□□ 1.21
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RGS11O94810 467 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV3-43DP0DP04 118 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 NFYBP25208 207 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 HEPN1Q6WQI6 88 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLET1Q6UQ28 207 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10V1Q8NGI7 309 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 DMRTB1Q96MA1 342 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 OCEL1Q9H607 264 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 RDH8Q9NYR8 311 aa22.57■■□□□ 1.2
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