RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 SSTP61278 116 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 IL24Q13007 206 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 OR10P1Q8NGE3 313 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 MOB3AQ96BX8 217 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 TUBD1Q9UJT1 453 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 PITPNC1Q9UKF7 332 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 CACNA1HO95180 2353 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 IGHMP01871 453 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF17P17021 662 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 KITLGP21583 273 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 RBM11P57052 281 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 OR10D3Q8NH80 312 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 PKDREJQ9NTG1 2253 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 K7N7A8 449 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 IGKV1-13P0DP09 117 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 SLC25A6P12236 298 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 FOLR2P14207 255 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 CD33P20138 364 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 CEACAM6P40199 344 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 MDH2P40926 338 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 ICAM4Q14773 271 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 C3AR1Q16581 482 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 OR10G4Q8NGN3 311 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 OR10G9Q8NGN4 311 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 OR10G7Q8NGN6 311 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 OR2T10Q8NGZ9 312 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 GPR146Q96CH1 333 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 BTF3L4Q96K17 158 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 HGFACQ04756 655 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 MSMO1Q15800 293 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 RABEPKQ7Z6M1 372 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 TXN2Q99757 166 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 TUBA4BQ9H853 241 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 PARD6AQ9NPB6 346 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 CLN8Q9UBY8 286 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 SYNGR1O43759 233 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 IGHV2-70P01814 119 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 IFI6P09912 130 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 DBX2Q6ZNG2 339 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 PLEKHA3Q9HB20 300 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 CLEC1BQ9P126 229 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 PROB1E7EW31 1015 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 IGKV1D-12P01611 117 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 HOXC12P31275 282 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 THBS3P49746 956 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 HIST1H3AP68431 136 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 MISP3Q96FF7 219 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 OR4C12Q96R67 309 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 GNG12Q9UBI6 72 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 VAX2Q9UIW0 290 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 A0A0U1RQV5 110 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 GRIFINA4D1Z8 144 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 CCL4P13236 92 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 SLC35B1P78383 322 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 C10orf91Q5T1B1 145 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 REC114Q7Z4M0 266 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 TPRX1Q8N7U7 411 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 SIRT7Q9NRC8 400 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRN-201ENST00000295718 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 MPZP25189 248 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 COL10A1Q03692 680 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 C14orf144Q96I85 54 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 ELOVL1Q9BW60 279 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 USP34Q70CQ2 3546 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 LRRC3CA6NJW4 275 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 ACTL6BO94805 426 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 MGST1P10620 155 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 CFHR1Q03591 330 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 M1APQ8TC57 530 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 TAAR9Q96RI9 348 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 RNF122Q9H9V4 155 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 CDH20Q9HBT6 801 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 ENY2Q9NPA8 101 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 PI4KAP42356 2102 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 WNK2Q9Y3S1 2297 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 AQP7O14520 342 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 CST2P09228 141 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 G6PCP35575 357 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 NXPH1P58417 271 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRN-201ENST00000295718 ARG2P78540 354 aa12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms