RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN2O60636 221 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 COL8A1P27658 744 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 CD82P27701 267 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 TUSC1Q2TAM9 212 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF880Q6PDB4 577 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZN92 141 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 OR5AU1Q8NGC0 362 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 OR8B3Q8NGG8 313 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 OR1L8Q8NGR8 309 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 RAB24Q969Q5 203 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 OR8B2Q96RD0 313 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 FUT9Q9Y231 359 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0J9YW62 118 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 DCAF12L2Q5VW00 463 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 DYRK2Q92630 601 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 NRIP2Q9BQI9 281 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 RP1P56715 2156 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 NMBP08949 121 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf100Q5SVJ3 147 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 OVCH2Q7RTZ1 564 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 OR1L6Q8NGR2 347 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 NPAS1Q99742 590 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 MS4A5Q9H3V2 200 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 ISG15P05161 165 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf113Q5VZT2 155 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 CHAC2Q8WUX2 184 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM255AQ5JRV8 349 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 FOCADQ5VW36 1801 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 OR4X1Q8NH49 305 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 CFHR5Q9BXR6 569 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 WASHC3Q9Y3C0 194 aa18.41■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 CEBPEQ15744 281 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 VWA1Q6PCB0 445 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 PET117Q6UWS5 81 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 RASL11BQ9BPW5 248 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 GPR132Q9UNW8 380 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 FAM157AC9JC47 383 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 MDP1Q86V88 176 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV39A0A0B4J263 110 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 M0QZK8 103 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 GGCTO75223 188 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 UPK3AO75631 287 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS1P07477 247 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 DOLPP1Q86YN1 238 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 CEACAM21Q3KPI0 293 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 TEX30Q5JUR7 227 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 B4E171 279 aa18.39■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 AGFG2O95081 481 aa18.39■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 BCL2P10415 239 aa18.39■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN7P41732 249 aa18.39■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 RPL30P62888 115 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2V2Q15819 145 aa18.39■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 Q8WTZ3 238 aa18.39■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 SMPD2O60906 423 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 CSN3P07498 182 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 NAGKQ9UJ70 344 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 INSIG2Q9Y5U4 225 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 FGF12P61328 243 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 RND1Q92730 232 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 OR10J1P30954 320 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 AESQ08117 197 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 PSG4Q00888 419 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM116Q8NCL8 245 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 KCNK17Q96T54 332 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 SEMA7AO75326 666 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 FDX2Q6P4F2 183 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD14BQ96IU4 210 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM204Q9BSN7 226 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 MIOXQ9UGB7 285 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 H0Y980 276 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 J3QR06 171 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 SSX8Q7RTT4 187 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 OR2J1Q9GZK6 312 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 FAM90A10PA6NDY2 464 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 FAM90A18PA6NE21 464 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 FAM90A16PA6NEW6 464 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 FAM90A7PA6NKC0 464 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 FAM90A22PA8MWA6 464 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 FAM90A12PA8MX19 464 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 ISLRO14498 428 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 GREM1O60565 184 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM11O75078 769 aa18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.6 ms