RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264350.7

HERC5-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC5, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5-201ENST00000264350 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 C19orf67A6NJJ6 358 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 B4E171 279 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 CYB5BO43169 146 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 TMEM50AO95807 157 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 ATP6V0CP27449 155 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 TSPAN7P41732 249 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
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HERC5-201ENST00000264350 TTTY12Q9BZ98 90 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 GTF3C1Q12789 2109 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 NKX2-8O15522 239 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 DTYMKP23919 212 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 HOXA6P31267 233 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 RHEBQ15382 184 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 KCNE4Q8WWG9 221 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 FAM173AQ9BQD7 235 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 TCEAL7Q9BRU2 100 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 PBDC1Q9BVG4 233 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 TMEM9BQ9NQ34 198 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 TDGF1P13385 188 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 ACP1P24666 158 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 ZNF716A6NP11 495 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 IFNL4K9M1U5 179 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 GATCO43716 136 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 FABP4P15090 132 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 FRZBQ92765 325 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 CRIM1Q9NZV1 1036 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 PRSS50Q9UI38 385 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC5-201ENST00000264350 COL6A6A6NMZ7 2263 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 RBFOX3A6NFN3 312 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 SYNGR1O43759 233 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 IGLV3-1P01715 115 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 SERPINE2P07093 398 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 DEFA6Q01524 100 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 C10orf35Q96D05 121 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 USF3Q68DE3 2245 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 NEURL1O76050 574 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 IFNA17P01571 189 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 CD59P13987 128 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 SELEP16581 610 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 B3GALT5-AS1P59052 145 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 ZNF154Q13106 437 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 SLC10A1Q14973 349 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 HMGN3Q15651 99 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 CMTM1Q8IZ96 169 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 C18orf12Q96KH6 178 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 TERTO14746 1132 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 RRP8O43159 456 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 SRP19P09132 144 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 RAB5CP51148 216 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 OR2T2Q6IF00 324 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 MOB3AQ96BX8 217 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 BOD1Q96IK1 185 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 FZR1Q9UM11 496 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa11.63□□□□□ -0.55
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HERC5-201ENST00000264350 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 IGKV1-13P0DP09 117 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 IAPPP10997 89 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 ICAM4Q14773 271 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 HIST3H2BBQ8N257 126 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 S100PBPQ96BU1 408 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 GALNT14Q96FL9 552 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 CHST1O43916 411 aa11.63□□□□□ -0.55
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HERC5-201ENST00000264350 TRGC1P0CF51 173 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 MAS1LP35410 378 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 DYNLT3P51808 116 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 HIST1H3AP68431 136 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 C1QL4Q86Z23 238 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 CD46P15529 392 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 UBE2KP61086 200 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 LILRB2Q8N423 598 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 GPR157Q5UAW9 335 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 THNSL2Q86YJ6 484 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 ZNF610Q8N9Z0 462 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC5-201ENST00000264350 SPIN2AQ99865 258 aa11.62□□□□□ -0.55
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