RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263966.7

USP13-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP13, Length 8,323 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-201ENST00000263966 LINC00469Q8N7U9 141 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 TSPAN32Q96QS1 320 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 ADAP1O75689 374 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 CST4P01036 141 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 HIST3H3Q16695 136 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 FSCN3Q9NQT6 498 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 ZNF117Q03924 483 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 SH2D5Q6ZV89 423 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 OR4B1Q8NGF8 309 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 MS4A10Q96PG2 267 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 PLPP3O14495 311 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 MEIG1Q5JSS6 88 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 RNF115Q9Y4L5 304 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 ZNF205O95201 554 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 WNT1P04628 370 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 ZNF688P0C7X2 276 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 DTX2Q86UW9 622 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 C11orf94C9JXX5 98 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 FFAR1O14842 300 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 NMUP48645 174 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 SP6Q3SY56 376 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 C11orf87Q6NUJ2 197 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 YIPF6Q96EC8 236 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 GPR61Q9BZJ8 451 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 NTN4Q9HB63 628 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 STARD10Q9Y365 291 aa14.54□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 CLEC9AQ6UXN8 241 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 Q6ZNB5 142 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 NXPH1P58417 271 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 TMEM37Q8WXS4 190 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 MSL2Q9HCI7 577 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 GPR27Q9NS67 375 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 PCSK4Q6UW60 755 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 TMEM174Q8WUU8 243 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 SLC25A20O43772 301 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 SFTA3P0C7M3 94 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 PSME4Q14997 1843 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 ORAI1Q96D31 301 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 WSB1Q9Y6I7 421 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 J3QR06 171 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 CFDP00746 253 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 ZNF137PP52743 207 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 H7C2G1 150 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 RECKO95980 971 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 OR10G8Q8NGN5 311 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 TBX15Q96SF7 602 aa14.53□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa14.52□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa14.52□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa14.52□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 28.6
USP13-201ENST00000263966 IL9P15248 144 aa14.52□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14.52□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 CA11O75493 328 aa14.52□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 IGLV3-27P01718 113 aa14.52□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 DYNLT3P51808 116 aa14.52□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 TTRP02766 147 aa14.52□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 GABRB1P18505 474 aa14.52□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 PSG9Q00887 426 aa14.52□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 IL24Q13007 206 aa14.52□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 NUDT11Q96G61 164 aa14.52□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.52□□□□□ -0.08
USP13-201ENST00000263966 SLC25A17O43808 307 aa14.52□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 MALP21145 153 aa14.52□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 FCARP24071 287 aa14.52□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 TMEM33P57088 247 aa14.52□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 C10orf128Q5T292 105 aa14.52□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 TMEM183AQ8IXX5 376 aa14.52□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 FLVCR2Q9UPI3 526 aa14.52□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 FGF5P12034 268 aa14.52□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 SCAND1P57086 179 aa14.52□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 POM121Q96HA1 1249 aa14.52□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 IFITM10A6NMD0 228 aa14.52□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 C17orf51A8MQB3 221 aa14.52□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 WNT3P56703 355 aa14.52□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 KLRB1Q12918 225 aa14.52□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 NRN1LQ496H8 165 aa14.52□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 WBP1LQ9NX94 342 aa14.52□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 A0A1B0GTH9 108 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 SAMD13Q5VXD3 122 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms