RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259216.4

CFC1-201, Transcript of cripto, FRL-1, cryptic family 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFC1, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1-201ENST00000259216 TPBGQ13641 420 aa16.09■□□□□ 0.17
CFC1-201ENST00000259216 EBI3Q14213 229 aa16.09■□□□□ 0.17
CFC1-201ENST00000259216 TMEM91Q6ZNR0 172 aa16.09■□□□□ 0.17
CFC1-201ENST00000259216 CAPSLQ8WWF8 208 aa16.09■□□□□ 0.17
CFC1-201ENST00000259216 FAM46BQ96A09 425 aa16.09■□□□□ 0.17
CFC1-201ENST00000259216 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CFC1-201ENST00000259216 ETAA1Q9NY74 926 aa16.09■□□□□ 0.17
CFC1-201ENST00000259216 GHRLQ9UBU3 117 aa16.09■□□□□ 0.17
CFC1-201ENST00000259216 TGP01266 2768 aa16.09■□□□□ 0.17
CFC1-201ENST00000259216 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 SLC31A2O15432 143 aa16.08■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 FAM106CPP0CH98 169 aa16.08■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 VSIG8P0DPA2 414 aa16.08■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 FUT3P21217 361 aa16.08■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 MED22Q15528 200 aa16.08■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 Q3ZCU0 254 aa16.08■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 OR10K2Q6IF99 312 aa16.08■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 C10orf99Q6UWK7 81 aa16.08■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 C1QL4Q86Z23 238 aa16.08■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 OR5AU1Q8NGC0 362 aa16.08■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 OR4K15Q8NH41 348 aa16.08■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 GFI1Q99684 422 aa16.08■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 MOB4Q9Y3A3 225 aa16.08■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 H3BUI4 141 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 M0QZK8 103 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 HSD17B6O14756 317 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 SLC22A1O15245 554 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 PDCD6O75340 191 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 CA11O75493 328 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 IGHV3-43DP0DP04 118 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 CHATP28329 748 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 ZNF134P52741 427 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 ZNF137PP52743 207 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 UNC119Q13432 240 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 SAMD5Q5TGI4 173 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 LIPKQ5VXJ0 399 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 Q6ZPA2 131 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 CEACAM19Q7Z692 300 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 Q8N6K4 173 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 C5orf56Q8N8D9 126 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 OR10X1Q8NGY0 326 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 OR1L1Q8NH94 360 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 KCNK15Q9H427 330 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 TPRKBQ9Y3C4 175 aa16.07■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa16.06■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 HBZP02008 142 aa16.06■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 SRMP19623 302 aa16.06■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 BEAN1Q3B7T3 259 aa16.06■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 C5orf24Q7Z6I8 188 aa16.06■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 ISYNA1Q9NPH2 558 aa16.06■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa16.06■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 UBE2QL1A1L167 161 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 TMEM14DPA8MWL7 114 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 G3V4G9 280 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 CCRL2O00421 344 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 RGS10O43665 173 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 MPIG6BO95866 241 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 UBBP0CG47 229 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 REG1BP48304 166 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 RPS25P62851 125 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 TMEM30BQ3MIR4 351 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 HSD17B12Q53GQ0 312 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 CT45A1Q5HYN5 189 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 C6orf183Q5T699 404 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 IZUMO2Q6UXV1 221 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 PRSS48Q7RTY5 328 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 IZUMO1Q8IYV9 350 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 CT45A3Q8NHU0 189 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 UFD1Q92890 307 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 TMEM203Q969S6 136 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 SULT4A1Q9BR01 284 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 TM2D1Q9BX74 207 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 CST11Q9H112 138 aa16.05■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 A0A0A6YYD4 124 aa16.04■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 FGF16O43320 207 aa16.04■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 PEX14O75381 377 aa16.04■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 IGKV1D-33P01593 117 aa16.04■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 IGKV1-33P01594 117 aa16.04■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 CPEP16870 476 aa16.04■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 HTR2CP28335 458 aa16.04■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 GLT8D1Q68CQ7 371 aa16.04■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 ZNF554Q86TJ5 538 aa16.04■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CFC1-201ENST00000259216 TAF9BQ9HBM6 251 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.8 ms