RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 ZNF525Q8N782 197 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 OR4F5Q8NH21 305 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 OR2AE1Q8NHA4 323 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 SPPL3Q8TCT6 385 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 OR4F4Q96R69 305 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 VAMP8Q9BV40 100 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 ZNF442Q9H7R0 627 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 IL23AQ9NPF7 189 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 ST3GAL6Q9Y274 331 aa18.23■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 A0A1W2PNR3 127 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 B4DGG1 531 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 TRAPPC6AO75865 159 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 IGKV1D-33P01593 117 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 IGKV1-33P01594 117 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 UCP1P25874 307 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 NSDHLQ15738 373 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 VN1R17PQ8TDU5 208 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 PXMP4Q9Y6I8 212 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 TNFP01375 233 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 IGKV1-13P0DP09 117 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 IAPPP10997 89 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 FOSL2P15408 326 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 TCN2P20062 427 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 CTSSP25774 331 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 C7orf61Q8IZ16 206 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 OR13H1Q8NG92 308 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 TMEM250H0YL14 139 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 SLC35E1Q96K37 410 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 MSL2Q9HCI7 577 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 PSMB3P49720 205 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 LCN2P80188 198 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 KCNMB1Q16558 191 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 TCF23Q7RTU1 214 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 OSR2Q8N2R0 312 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 GABRG3Q99928 467 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 C2orf16Q68DN1 1984 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-201ENST00000234111 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 SERF2P84101 59 aa18.2■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 MMDQ15546 238 aa18.2■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 WDR5BQ86VZ2 330 aa18.2■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 OR1N1Q8NGS0 311 aa18.2■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 WDYHV1Q96HA8 205 aa18.2■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa18.2■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 A0A1W2PR80 420 aa18.2■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 C20orf202A1L168 122 aa18.2■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 MLF1P58340 268 aa18.2■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 RANP62826 216 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 HAPLN4Q86UW8 402 aa18.2■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 ZNF441Q8N8Z8 693 aa18.2■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 EXTL1Q92935 676 aa18.2■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 SLC25A22Q9H936 323 aa18.2■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 TMEM9BQ9NQ34 198 aa18.2■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 CCL28Q9NRJ3 127 aa18.2■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 M0R135 149 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 CCL25O15444 150 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 PDCD6O75340 191 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 ADMP35318 185 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 MALLQ13021 153 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 SPSB1Q96BD6 273 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 GPR146Q96CH1 333 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 ZNF799Q96GE5 643 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 HSPB9Q9BQS6 159 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 F5P12259 2224 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 NDUFB8O95169 186 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 TMEM240Q5SV17 173 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 ETFRF1Q6IPR1 90 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 OR51B6Q9H340 312 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 A0A1W2PQF6 199 aa18.18■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 FOXL2P58012 376 aa18.18■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 PPP1CBP62140 327 aa18.18■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 BORCS8Q96FH0 119 aa18.18■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 PLSCR2Q9NRY7 297 aa18.18■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 SLC22A20A6NK97 555 aa18.18■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 C17orf67Q0P5P2 114 aa18.18■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 OR8B8Q15620 311 aa18.18■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 GJC3Q8NFK1 279 aa18.18■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 RAB40CQ96S21 281 aa18.18■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms