RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 P2RX4Q99571 388 aa6.31□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.31□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 A0A1W2PPC1 479 aa6.31□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TTRP02766 147 aa6.31□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 NPY1RP25929 384 aa6.31□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 KCNMB1Q16558 191 aa6.31□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.31□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CBLN3Q6UW01 205 aa6.31□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 LRRC3BQ96PB8 259 aa6.31□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TP53RKQ96S44 253 aa6.31□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.31□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 CHST1O43916 411 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 ARG1P05089 322 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CCL3P10147 92 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 FGF5P12034 268 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 ZNF519Q8TB69 540 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.3□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 PRR33A8MZF0 331 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 MGST3O14880 152 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 WNT9BO14905 357 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 HBZP02008 142 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 FGF12P61328 243 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 RTP5Q14D33 572 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 DOK5Q9P104 306 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SOCS1O15524 211 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 ISG15P05161 165 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 FAM106CPP0CH98 169 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 GZMMP51124 257 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 STPG3Q8N7X2 389 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 NEURL2Q9BR09 285 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CCL2P13500 99 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 RFESDQ8TAC1 157 aa6.3□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.3□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 MVDP53602 400 aa6.3□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CLN8Q9UBY8 286 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.3□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 A6NJY4 79 aa6.29□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 COX6B1P14854 86 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 COL8A1P27658 744 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SELENOTP62341 195 aa6.29□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 PRO1933Q9H354 126 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.29□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SPINK9Q5DT21 86 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 OR4A47Q6IF82 309 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 OR2V2Q96R30 315 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 LIPGQ9Y5X9 500 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 A0A1B0GV72 72 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CDIPTO14735 213 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 VSIG8P0DPA2 414 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 PRDX2P32119 198 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 B2MP61769 119 aa6.29□□□□□ -1.4
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