RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF44P15621 663 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 GZMHP20718 246 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 GNRHRP30968 328 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 MPV17P39210 176 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 FABP6P51161 128 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 CASP6P55212 293 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 PRSS12P56730 875 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 UBA52P62987 128 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 CR1LQ2VPA4 569 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 SPATA46Q5T0L3 261 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 GPR157Q5UAW9 335 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 TMEM108Q6UXF1 575 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 BVESQ8NE79 360 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 NEK7Q8TDX7 302 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 S100PBPQ96BU1 408 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 SEC22AQ96IW7 307 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 ARL6Q9H0F7 186 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 FXYD6Q9H0Q3 95 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 DNTTIP1Q9H147 329 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 PLEKHA2Q9HB19 425 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 SLC2A9Q9NRM0 540 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 TAAR3PQ9P1P4 343 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 IL19Q9UHD0 177 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 AUP1Q9Y679 476 aa8.99□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 ZFHX3Q15911 3703 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 NF1P21359 2839 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 FREM1Q5H8C1 2179 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 A0A1W2PR80 420 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 RNF222A6NCQ9 220 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 OOEPA6NGQ2 149 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 HS3ST1O14792 307 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 MLNRO43193 412 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 RHBDL1O75783 438 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 OR2H2O95918 312 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 GRPP07492 148 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 SCTP09683 121 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 BMP5P22003 454 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 TNFSF4P23510 183 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 CCKARP32238 428 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 HTR2BP41595 481 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 HLA-DRB3P79483 266 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 SMCO1Q147U7 214 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 SMIM21Q3B7S5 101 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 FAM209AQ5JX71 171 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 BRICD5Q6PL45 260 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 ACP7Q6ZNF0 438 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 WDR86Q86TI4 376 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 OR5D13Q8NGL4 314 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 LINC01560Q8TB33 94 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 GLYATL2Q8WU03 294 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 MAFIPQ8WZ33 124 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 C18orf12Q96KH6 178 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 AQP10Q96PS8 301 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 SPIN2AQ99865 258 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 RNF126Q9BV68 326 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 ABCA4P78363 2273 aa8.98□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 ITPR3Q14573 2671 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 FAM221AA4D161 298 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 FAM25EA8MYX2 175 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 BCL2L11O43521 198 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 TSC22D2O75157 780 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 HAND1O96004 215 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 LHBP01229 141 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 MMP9P14780 707 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 AADACP22760 399 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 DUSP1P28562 367 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 SLC9A3R2Q15599 337 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 HMGN3Q15651 99 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 TSC22D1Q15714 1073 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 C6orf183Q5T699 404 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 WDR82Q6UXN9 313 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 Q6ZR03 302 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 OR8H3Q8N146 312 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 OR5T2Q8NGG2 359 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 STOML3Q8TAV4 291 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 C14orf79Q96F83 325 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 OR51B6Q9H340 312 aa8.97□□□□□ -0.97
CDCA3-201ENST00000229265 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms