RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021424.4

Sptlc2-201, Transcript of Serine palmitoyltransferase 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sptlc2, Length 6,710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 PilrbQ2YFS2 224 aa13.72□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 B230104I21RikQ3USW4 141 aa13.72□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 B130006D01RikQ8BRH6 153 aa13.72□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Lmf2Q8C3X8 702 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Wfikkn1Q8R0S6 552 aa13.72□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Wwtr1Q9EPK5 395 aa13.72□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pou3f3P31361 497 aa13.72□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Fgf7P36363 194 aa13.72□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 GalP47212 124 aa13.72□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Nmnat3Q99JR6 245 aa13.72□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Jam3Q9D8B7 310 aa13.72□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 HraslsQ9QZU4 167 aa13.72□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Vmn1r175K7N6T9 304 aa13.72□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Usf1Q61069 310 aa13.72□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Q9DAD0 168 aa13.72□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm5286E0CXI6 357 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Sf3a2Q62203 475 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Hs3st3a1Q8BKN6 393 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Harbi1Q8BR93 349 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Olfr995Q8VF74 315 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 H1fooQ8VIK3 304 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rpp14Q9CQH8 122 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rab1bQ9D1G1 201 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 C1qtnf3Q9ES30 246 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Abca15E9PWH4 1668 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm11009F7CWA7 138 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Zbtb25G3UW50 439 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm9733Q1AN91 178 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Grxcr2Q3TYR5 254 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Slc7a15Q50E62 488 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tspan12Q8BKT6 305 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Olfr936J3KMV2 267 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 G530012D18RikJ3QK25 139 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Mep1aP28825 747 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Mfap2P55002 183 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Zdhhc25Q810M4 279 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gprin3Q8BWS5 763 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Olfr354Q8VGJ8 317 aa13.71□□□□□ -0.21
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ifna4P07351 186 aa13.71□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Fcer1aP20489 250 aa13.71□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Nkx2-6P43688 289 aa13.71□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gpr143P70259 405 aa13.71□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 1700012B07RikQ3V0S8 276 aa13.71□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tmem108Q8BHE4 574 aa13.71□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rbmxl1Q91VM5 388 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Opn4Q9QXZ9 521 aa13.71□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ccl8Q9Z121 97 aa13.71□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cln5Q3UMW8 341 aa13.71□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Spem1Q5F289 310 aa13.71□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Flrt1Q6RKD8 674 aa13.71□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Fam117aQ7TNF9 451 aa13.71□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Olfr358Q7TRY5 330 aa13.71□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 SdhaQ8K2B3 664 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Olfr1170Q8VFG1 316 aa13.71□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Defb6Q91VD6 63 aa13.71□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Flywch2Q9CQE9 139 aa13.71□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Igkv1-131A0A140T8M8 120 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 H2-LP01897 362 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cnrip1Q5M8N0 164 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Adam26bQ6IMH6 699 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Slc52a3Q9D6X5 460 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cypt3B1AY64 174 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm20767O70517 169 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tpsb2P21845 276 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Slc38a11Q3USY0 453 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tra2aQ6PFR5 281 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Lrtm2Q8BGX3 370 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ino80cQ8BHA0 191 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Lamtor1Q9CQ22 161 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 2010106E10RikA2ANY3 279 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Olfr869E9PX82 323 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cdx2P43241 311 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 LmlnQ8BMN4 681 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ube3dQ8BX13 368 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 PbkQ9JJ78 330 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 HgfacQ9R098 653 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Phrf1A6H619 1682 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 CN725425A0A087WRU1 652 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Dmrtb1A2A9I7 359 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 MgllO35678 303 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Twist1P26687 206 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 ArsbP50429 534 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Zdhhc8Q5Y5T5 762 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Olfr147Q60886 317 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Acer2Q8VD53 275 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Zcchc14Q8VIG0 956 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rnf165E9QAU8 347 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm3512L7N206 146 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm15292L7N231 93 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 CckarO08786 436 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 HgdO09173 445 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Etv2P41163 335 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ppp1cbP62141 327 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Defb46Q4QY34 57 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 RflnbQ5SVD0 216 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 IfnkQ7TSL0 199 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tomm34Q9CYG7 309 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pla2g12aQ9EPR2 192 aa13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Dnajb12Q9QYI4 376 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 KcpQ3U492 1550 aa13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.7 ms