RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636337.1

SPTAN1-231, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-231	ENST00000636337	MRO	Q9BYG7	248 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	MFF	Q9GZY8	342 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	CMTM6	Q9NX76	183 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A1B0GTI1	187 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	OR2A4	O95047	310 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	NCK1	P16333	377 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	ALOX5AP	P20292	161 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	VHL	P40337	213 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	ALDH3A2	P51648	485 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	VSNL1	P62760	191 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	LIPE	Q05469	1076 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	LSAMP	Q13449	338 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	RPEL1	Q2QD12	228 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	COQ5	Q5HYK3	327 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q6P435	159 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	LINC00311	Q8N616	119 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	OR2T33	Q8NG76	320 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	RCN3	Q96D15	328 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	CMC2	Q9NRP2	79 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	PEMT	Q9UBM1	199 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	PRR32	B1ATL7	298 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	DEGS1	O15121	323 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC31A2	O15432	143 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	MAGEB3	O15480	346 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	E2F6	O75461	281 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	SOX14	O95416	240 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRBV12-3	P01733	135 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	KIR2DS2	P43631	304 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	RBP2	P50120	134 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	APOC4	P55056	127 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	CX3CL1	P78423	397 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	RDH12	Q96NR8	316 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	GID8	Q9NWU2	228 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	RNF150	Q9ULK6	438 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	DHDH	Q9UQ10	334 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	AIRE	O43918	545 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGKV1D-12	P01611	117 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	RRM2	P31350	389 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	ATP1B3	P54709	279 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	MTCP1	P56278	107 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q6ZSR3	168 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	LFNG	Q8NES3	379 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	UBALD1	Q8TB05	177 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	CHST5	Q9GZS9	411 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	GAB2	Q9UQC2	676 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337		V9GYQ6	96 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A0G2JLM5	398 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SPTAN1-231	ENST00000636337		H0YJX3	145 aa		7.24	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms