RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 MED30Q96HR3 178 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 TAF9BQ9HBM6 251 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHB10Q9UN67 800 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR132Q9UNW8 380 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 TMPRSS2O15393 492 aa20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 VSIG10L2P0DP72 767 aa20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 FPR2P25090 351 aa20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 ERP29P30040 261 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 CDKN1AP38936 164 aa20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 P2RX3P56373 397 aa20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM185AQ8NFB2 350 aa20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 KIRREL1Q96J84 757 aa20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM246Q9BRR3 403 aa20.71■□□□□ 0.91
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNIP1Q9NZI2 227 aa20.71■□□□□ 0.91
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CAPNS1-215ENST00000628018 LY6HO94772 140 aa20.7■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 DAOP14920 347 aa20.7■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 ECI1P42126 302 aa20.7■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNJ8Q15842 424 aa20.7■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 C6orf183Q5T699 404 aa20.7■□□□□ 0.9
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CAPNS1-215ENST00000628018 SCGB3A2Q96PL1 93 aa20.7■□□□□ 0.9
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CAPNS1-215ENST00000628018 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
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CAPNS1-215ENST00000628018 TMED4Q7Z7H5 227 aa20.69■□□□□ 0.9
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CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV2-70P01814 119 aa20.68■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 COX6B1P14854 86 aa20.68■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAT1Q6PIZ9 186 aa20.68■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 LYPD2Q6UXB3 125 aa20.68■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A42Q86VD7 318 aa20.68■□□□□ 0.9
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CAPNS1-215ENST00000628018 SEC22CQ9BRL7 303 aa20.68■□□□□ 0.9
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CAPNS1-215ENST00000628018 C5orf66Q9H5L9 145 aa20.68■□□□□ 0.9
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CAPNS1-215ENST00000628018 DCTN5Q9BTE1 182 aa20.68■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 OR51J1Q9H342 316 aa20.68■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 HMX3A6NHT5 357 aa20.67■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAM20O43506 726 aa20.67■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 F12P00748 615 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 PPYP01298 95 aa20.67■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4E1P0C645 316 aa20.67■□□□□ 0.9
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CAPNS1-215ENST00000628018 OR10J5Q8NHC4 309 aa20.67■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 IL1F10Q8WWZ1 152 aa20.67■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 OPN4Q9UHM6 478 aa20.67■□□□□ 0.9
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CAPNS1-215ENST00000628018 TRAPPC2BP0DI82 140 aa20.66■□□□□ 0.9
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CAPNS1-215ENST00000628018 UCP3P55916 312 aa20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF565Q8N9K5 539 aa20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 OR1L1Q8NH94 360 aa20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 UBALD1Q8TB05 177 aa20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 C14orf79Q96F83 325 aa20.66■□□□□ 0.9
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CAPNS1-215ENST00000628018 C15orf65H3BRN8 121 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 HBZP02008 142 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 HEXAP06865 529 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 PGAM2P15259 253 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 EFNA4P52798 201 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 HERV-K104P61576 105 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
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