RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 SSX5O60225 188 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 MELTFP08582 738 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 FCGR3AP08637 254 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 CCL3L1P16619 93 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 SSTR5P35346 364 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ARF6P62330 175 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 PAX2Q02962 417 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 C6orf183Q5T699 404 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 DCAF12L2Q5VW00 463 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 Q6ZPA2 131 aa7.01□□□□□ -1.29
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SGMS1-211ENST00000626236 GLCCI1Q86VQ1 547 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 PRR18Q8N4B5 295 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF565Q8N9K5 539 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 UBALD1Q8TB05 177 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 MAFIPQ8WZ33 124 aa7.01□□□□□ -1.29
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SGMS1-211ENST00000626236 TMEM186Q96B77 213 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 C18orf12Q96KH6 178 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF714Q96N38 554 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 IFT46Q9NQC8 304 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 HIF1ANQ9NWT6 349 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 V9GYH0 126 aa7.01□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 NOTCH2Q04721 2471 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ZANQ9Y493 2812 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 C12orf77C9JDV5 145 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 TPPPO94811 219 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 FCER2P06734 321 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 LPLP06858 475 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 INHBBP09529 407 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF728P0DKX0 622 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 CD99P14209 185 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 GZMHP20718 246 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 OMGP23515 440 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 DTYMKP23919 212 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ETV6P41212 452 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 CBX5P45973 191 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ERVFRD-1P60508 538 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 HLA-DRB3P79483 266 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 LTC4SQ16873 150 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 C17orf58Q2M2W7 97 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 PYDC2Q56P42 97 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 METTL11BQ5VVY1 283 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF880Q6PDB4 577 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 KIR3DL3Q8N743 410 aa7□□□□□ -1.29
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SGMS1-211ENST00000626236 FCAMRQ8WWV6 532 aa7□□□□□ -1.29
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SGMS1-211ENST00000626236 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 FAHD2AQ96GK7 314 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 SOSTQ9BQB4 213 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 PCGF1Q9BSM1 259 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 SCPEP1Q9HB40 452 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 TAF9BQ9HBM6 251 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 Q9N2K0 584 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 TAS2R3Q9NYW6 316 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 CALYQ9NYX4 217 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 OPN4Q9UHM6 478 aa7□□□□□ -1.29
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SGMS1-211ENST00000626236 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PPE2 198 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PR64 198 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PRV1 198 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 C17orf98A8MV24 154 aa6.99□□□□□ -1.29
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SGMS1-211ENST00000626236 C15orf65H3BRN8 121 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 GABARAPH6UMI1 98 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 M0R1W7 72 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 SULT1C2O00338 296 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 CTDSPLO15194 276 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 SPINT2O43291 252 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 CD5LO43866 347 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ORC5O43913 435 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 TOX4O94842 621 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 HBZP02008 142 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 CGB3P0DN86 165 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 CGB7P0DN87 165 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 GATA3P23771 443 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.292e-9■■□□□ 12.7
SGMS1-211ENST00000626236 DLX1P56177 255 aa6.99□□□□□ -1.29
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