RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.13□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 GHITMQ9H3K2 345 aa6.13□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.13□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.13□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 A1L4Q6 167 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM235A6NFC5 223 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 ORC5O43913 435 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 LIPFP07098 398 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 IL7P13232 177 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 SLC25A16P16260 332 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM11P17152 192 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 AMY2BP19961 511 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
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SMAD4-210ENST00000590061 TMEM50BP56557 158 aa6.12□□□□□ -1.43
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SMAD4-210ENST00000590061 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 ASAH1Q13510 395 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 STUMQ69YW2 141 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 Q6P435 159 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 GAPTQ8N292 157 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
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SMAD4-210ENST00000590061 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 OR8B2Q96RD0 313 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 JMJD8Q96S16 334 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM165Q9HC07 324 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 CREBBPQ92793 2442 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.11□□□□□ -1.43
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SMAD4-210ENST00000590061 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 RAG2P55895 527 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 P2RX3P56373 397 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 TSPAN5P62079 268 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 COL10A1Q03692 680 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 CDK10Q15131 360 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF79Q15937 498 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 Q3ZCU0 254 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 VAX1Q5SQQ9 334 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 OR52W1Q6IF63 320 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.11□□□□□ -1.43
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SMAD4-210ENST00000590061 BEST4Q8NFU0 473 aa6.11□□□□□ -1.43
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SMAD4-210ENST00000590061 OR52I2Q8NH67 350 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 ENKURQ8TC29 256 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 CORO2AQ92828 525 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 SNAPC3Q92966 411 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 YIPF5Q969M3 257 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 GALMQ96C23 342 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 NICN1Q9BSH3 213 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 AK3Q9UIJ7 227 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 RELNP78509 3460 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 TACC2O95359 2948 aa6.1□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.1□□□□□ -1.43
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