RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 LINC00312Q9Y6C7 94 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 CR1P17927 2039 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 MEIS3P1A6NDR6 274 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 IL7P13232 177 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 GDNFP39905 211 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 KIR2DS4P43632 304 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 KIR2DS1Q14954 304 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 LYSMD2Q8IV50 215 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 BEST4Q8NFU0 473 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 OR13A1Q8NGR1 328 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 BORCS5Q969J3 196 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 Q96MF0 132 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 TAS2R3Q9NYW6 316 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 ABCA2Q9BZC7 2435 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-210ENST00000568388 LOC105371242A0A075B767 164 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 TRDCB7Z8K6 153 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 FOXH1O75593 365 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 CSF1P09603 554 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 GSTT2BP0CG30 244 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 HMGN3Q15651 99 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM200BQ69YZ2 307 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 TCF23Q7RTU1 214 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM229BQ8NBD8 167 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 SETD6Q8TBK2 473 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 DEDD2Q8WXF8 326 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 SNAPC3Q92966 411 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 REG4Q9BYZ8 158 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 LINC00574Q9H8X3 128 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 KCNIP1Q9NZI2 227 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 ANXA10Q9UJ72 324 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 WNK2Q9Y3S1 2297 aa15.44■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa15.44■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 TRAV39A0A0B4J263 110 aa15.44■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa15.44■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 UPK1BO75841 260 aa15.44■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 IL2RGP31785 369 aa15.44■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 HLA-DRB3P79483 266 aa15.44■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 TRIQKQ629K1 86 aa15.44■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 MRGPRDQ8TDS7 321 aa15.44■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 MAFIPQ8WZ33 124 aa15.44■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 TAF9BQ9HBM6 251 aa15.44■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 A0A1W2PPH5 198 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 C22orf46C9J442 243 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 FAM157AC9JC47 383 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 C12orf77C9JDV5 145 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 C15orf65H3BRN8 121 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 DIRAS3O95661 229 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 CD74P04233 296 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 TBPP20226 339 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 GLP1RP43220 463 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 TAS2R19P59542 299 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 AP3S2P59780 193 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 PAX2Q02962 417 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 TOMM5Q8N4H5 51 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 OR5AP2Q8NGF4 316 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 OR4A4PQ8NGN8 299 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 RAB9BQ9NP90 201 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP15.42■□□□□ 0.068e-8■■■□□ 17.8
SPNS1-210ENST00000568388 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 RNF223E7ERA6 249 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 FABP7O15540 132 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 LIPFP07098 398 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 CTXN2P0C2S0 81 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 GSTT2P0CG29 244 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 PPIAL4GP0DN37 164 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 DLX6P56179 175 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 TAS2R46P59540 309 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 DYRK1AQ13627 763 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF273Q14593 569 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 C17orf58Q2M2W7 97 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 ACTBL2Q562R1 376 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 OR52W1Q6IF63 320 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 FAM185AQ8N0U4 392 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 WFDC11Q8NEX6 87 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 OR10A7Q8NGE5 316 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 ARL11Q969Q4 196 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 PALMDQ9NP74 551 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 ABCB10Q9NRK6 738 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 CALYQ9NYX4 217 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 A0A1W2PQ09 198 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 SPINT2O43291 252 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS1-210ENST00000568388 ENSAO43768 121 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms