RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TGFBR1P36897 503 aa10.5□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VEGFCP49767 419 aa10.5□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EFNB2P52799 333 aa10.5□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PLA2G7Q13093 441 aa10.5□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DEFB112Q30KQ8 113 aa10.5□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C6orf183Q5T699 404 aa10.5□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF626Q68DY1 528 aa10.5□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRAT1Q6PIZ9 186 aa10.5□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa10.5□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa10.5□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR10A7Q8NGE5 316 aa10.5□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DYRK2Q92630 601 aa10.5□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CLEC7AQ9BXN2 247 aa10.5□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RAB9BQ9NP90 201 aa10.5□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM96BQ9Y3D0 163 aa10.5□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A1W2PRD5 423 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A1W2PRF3 423 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A1W2PRM7 423 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OMGP23515 440 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CD34P28906 385 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GDNFP39905 211 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NCS1P62166 190 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IDNKQ5T6J7 187 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 Q6ZTK2 550 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF554Q86TJ5 538 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RTN4RL2Q86UN3 420 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LDLRAD3Q86YD5 345 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR4K15Q8NH41 348 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LGALS14Q8TCE9 139 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCDC107Q8WV48 283 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZDHHC16Q969W1 377 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIRREL1Q96J84 757 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAAP24Q9BTP7 215 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ETV7Q9Y603 341 aa10.49□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRAV39A0A0B4J263 110 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C15orf65H3BRN8 121 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CLDN34H7C241 214 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SCGNO76038 276 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VENTXO95231 258 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NAPSAO96009 420 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PAHP00439 452 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARG1P05089 322 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RPS19P39019 145 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SERPINB10P48595 397 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LGALS4P56470 323 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM50BP56557 158 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VBP1P61758 197 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BAMBIQ13145 260 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CTF1Q16619 201 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM30BQ3MIR4 351 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PLAC9Q5JTB6 97 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GPR107Q5VW38 600 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 Q6YL49 198 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MOB1BQ7L9L4 216 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR10R2Q8NGX6 335 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZFAND2BQ8WV99 257 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARL11Q969Q4 196 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC25A46Q96AG3 418 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RAB3CQ96E17 227 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CYYR1Q96J86 154 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PECRQ9BY49 303 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ESM1Q9NQ30 184 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNRD1Q9P1U0 126 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AK3Q9UIJ7 227 aa10.48□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 POM121CA8CG34 1229 aa10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C12orf77C9JDV5 145 aa10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRIM77I1YAP6 450 aa10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RAB27BO00194 218 aa10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 F2RL2O00254 374 aa10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SPINT2O43291 252 aa10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MELTFP08582 738 aa10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NFYBP25208 207 aa10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RPL5P46777 297 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARL6IP1Q15041 203 aa10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MOGAT2Q3SYC2 334 aa10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MINOS1Q5TGZ0 78 aa10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ABHD12Q8N2K0 398 aa10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM86BQ8N661 226 aa10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZDHHC22Q8N966 263 aa10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BEND2Q8NDZ0 799 aa10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR52M1Q8NGK5 317 aa10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF596Q8TC21 504 aa10.47□□□□□ -0.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SSMEM1Q8WWF3 244 aa10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms