RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553628.1

AC009396.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC009396.1, Length 1,079 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 ARPC3O15145 178 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 RTL8CO15255 209 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 SYNGR1O43759 233 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 SPAG7O75391 227 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 STX11O75558 287 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 RBP1P09455 135 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 IMPDH1P20839 514 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 RPS5P46782 204 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 CAV2P51636 162 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 ST3GAL3Q11203 375 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 SYPL1Q16563 259 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 FAM83EQ2M2I3 478 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 TMEM225Q6GV28 225 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 PPP1R27Q86WC6 154 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 MREGQ8N565 214 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF283Q8N7M2 679 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 CDRT4Q8N9R6 151 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 C10orf82Q8WW14 230 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 ST8SIA1Q92185 356 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 PIGCQ92535 297 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 FGGYQ96C11 551 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 ISOC1Q96CN7 298 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF799Q96GE5 643 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 TSSK3Q96PN8 268 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF382Q96SR6 550 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 TMEM109Q9BVC6 243 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 GON7Q9BXV9 100 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 UFSP2Q9NUQ7 469 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 AHSPQ9NZD4 102 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 PIPOXQ9P0Z9 390 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 GNG12Q9UBI6 72 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 VPS29Q9UBQ0 182 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 CLN8Q9UBY8 286 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.4□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 METTL21EPA6NDL7 271 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 BTBD17A6NE02 478 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 SYCE1LA8MT33 242 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 F5H5P2 479 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 NPFFO15130 113 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 ENSAO43768 121 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 C6orf47O95873 294 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 HLA-DPB1P04440 258 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 IFNW1P05000 195 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 OR8U8P0C7N1 319 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 OR12D1P0DN82 309 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 CD24P25063 80 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 ALDH3A1P30838 453 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 KIR2DS4P43632 304 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 DNAJB13P59910 316 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 RPS23P62266 143 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 AANATQ16613 207 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 LRRC36Q1X8D7 754 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF404Q494X3 552 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 TMEM155Q4W5P6 130 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 OR8G2PQ6IF36 304 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 HCP5Q6MZN7 132 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 FAM71F2Q6NXP2 309 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 GRINAQ7Z429 371 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 TMEM17Q86X19 198 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 C10orf107Q8IVU9 208 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 BHLHE23Q8NDY6 225 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 OR4K5Q8NGD3 323 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 OR8B3Q8NGG8 313 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 PIFOQ8TCI5 191 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 TCP10LQ8TDR4 215 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 ACMSDQ8TDX5 336 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 C11orf40Q8WZ69 217 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 SLC7A6Q92536 515 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 PELI1Q96FA3 418 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 PKNOX2Q96KN3 472 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 FCRL1Q96LA6 429 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 TEX37Q96LM6 180 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 OR8B2Q96RD0 313 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 SDF2Q99470 211 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 SORT1Q99523 831 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 CCT7Q99832 543 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 NABP2Q9BQ15 211 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 NICN1Q9BSH3 213 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 POFUT2Q9Y2G5 429 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 FIS1Q9Y3D6 152 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa3.39□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa3.38□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa3.38□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa3.38□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.38□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 C5orf49A4QMS7 147 aa3.38□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 FTCDNL1E5RQL4 147 aa3.38□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa3.38□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
AC009396.1-201ENST00000553628 SMIM24O75264 130 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms