RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR160	Q9UJ42	338 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	DNHD1	Q96M86	4753 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	NCKAP5	O14513	1909 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	RNF212B	A8MTL3	300 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	IFNL4	K9M1U5	179 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR137B	O60478	399 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	IGHV3-9	P01782	118 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	HOXB5	P09067	269 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	SEC11B	P0C7V7	166 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	BCL3	P20749	454 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	VDAC1	P21796	283 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	OPRM1	P35372	400 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	RFC3	P40938	356 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	UCP2	P55851	309 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	PPP1CB	P62140	327 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	RAB32	Q13637	225 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	OR8G1	Q15617	311 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	MDP1	Q86V88	176 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	OR10C1	Q96KK4	312 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	MMP26	Q9NRE1	261 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	POLE	Q07864	2286 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442		A0A1B0GWJ7	208 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442		H0Y980	276 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	SMPD2	O60906	423 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	WDR1	O75083	606 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	ADAP1	O75689	374 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	KITLG	P21583	273 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	LMO1	P25800	156 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	UCP1	P25874	307 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	WNT5A	P41221	380 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	NPBWR2	P48146	333 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	CCL11	P51671	97 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	ERVK11-1	P61568	191 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	BAX	Q07812	192 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF266	Q14584	549 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	HMGN3	Q15651	99 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF695	Q8IW36	515 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	SMIM8	Q96KF7	97 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	ARV1	Q9H2C2	271 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	RAB9B	Q9NP90	201 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	PARP11	Q9NR21	331 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	PRSS50	Q9UI38	385 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442		H0YIZ8	118 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIM77	I1YAP6	450 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	HSPA12A	O43301	675 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	PLAT	P00750	562 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	NGF	P01138	241 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	OR5AC1	P0C628	307 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	PGA5	P0DJD9	388 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	HKR1	P10072	659 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	PRKACA	P17612	351 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	AADAC	P22760	399 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	SULT1A2	P50226	295 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442		Q8NA96	180 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	NEK7	Q8TDX7	302 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	TOMM40L	Q969M1	308 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	MED12	Q93074	2177 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442		A0A1B0GU03	582 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	UMAD1	C9J7I0	102 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	IGLV1-44	P01699	117 aa		10.04	□□□□□ -0.8
LETMD1-223	ENST00000550442	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8

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