RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 MMP23AO75900 390 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 AMY2AP04746 511 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 MELTFP08582 738 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 GPR176Q14439 515 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 TRAM1Q15629 374 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 GLT8D1Q68CQ7 371 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 OR10K2Q6IF99 312 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 SUMF2Q8NBJ7 301 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 TMEM104Q8NE00 496 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 PHYHIPQ92561 330 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 FAM46BQ96A09 425 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 SLC25A28Q96A46 364 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 Q96M66 194 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 BARHL1Q9BZE3 327 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 SELENOIQ9C0D9 397 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 CDIP1Q9H305 208 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 KIF25Q9UIL4 384 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 MEIKINA0A087WXM9 373 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 SHISA3A0PJX4 238 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 ODAMA1E959 279 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 FAM172BPA6NC97 362 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 PRSS47A8MTI9 375 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 PAHP00439 452 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 IGHV4-59P01825 116 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 ARG1P05089 322 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 CSN2P05814 226 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 MGMTP16455 207 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 CALRP27797 417 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 PSMB9P28065 219 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 GABRA5P31644 462 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 GDNFP39905 211 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 LGALS4P56470 323 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 NHLRC3Q5JS37 347 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 C16orf87Q6PH81 154 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 NEK7Q8TDX7 302 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 CORO2AQ92828 525 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 GFI1Q99684 422 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 UQCC2Q9BRT2 126 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 KCNK15Q9H427 330 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 ARL6IP5O75915 188 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 MPIG6BO95866 241 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 FBP1P09467 338 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 CDK2P24941 298 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 HTR2CP28335 458 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 GLP1RP43220 463 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 IER3P46695 156 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 P2RY14Q15391 338 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 MPV17LQ2QL34 196 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 CT83Q5H943 113 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 UBE2UQ5VVX9 321 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 ZNF773Q6PK81 442 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 ZNF565Q8N9K5 539 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 OR13D1Q8NGV5 346 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 RFESDQ8TAC1 157 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 CCDC107Q8WV48 283 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 AJUBAQ96IF1 538 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 CYYR1Q96J86 154 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 CHIAQ9BZP6 476 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 TAS2R3Q9NYW6 316 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 OR6C3Q9NZP0 311 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 UBE2QL1A1L167 161 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 CLDN34H7C241 214 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 CCRL2O00421 344 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 TIMM23O14925 209 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 CLPXO76031 633 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 IGHV3-7P01780 117 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 RBP4P02753 201 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 CGB3P0DN86 165 aa7.79□□□□□ -1.16
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