RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 PPP1CBP62140 327 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 ATP6V1FQ16864 119 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 CARD17Q5XLA6 110 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 ODF3L1Q8IXM7 274 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 RBKSQ9H477 322 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 IL17BQ9UHF5 180 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 RFNGQ9Y644 331 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 METTL12A8MUP2 240 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 B4DGG1 531 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 LINC01565O15544 149 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 SOX15O60248 233 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 TMEM50AO95807 157 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 GYPAP02724 150 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 SERPINE2P07093 398 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 GLI4P10075 376 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 CCR5P51681 352 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 PAX9P55771 341 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 RBM11P57052 281 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 PLPPR5Q32ZL2 321 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 ZNF525Q8N782 197 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 RNF138Q8WVD3 245 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 TMEM54Q969K7 222 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 WDYHV1Q96HA8 205 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 TBX15Q96SF7 602 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 PARD6AQ9NPB6 346 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 ASCL3Q9NQ33 180 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 SLC7A10Q9NS82 523 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 ST3GAL6Q9Y274 331 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 ZFP30Q9Y2G7 519 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.32□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 FAM90A26D6RGX4 464 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 TUSC2O75896 110 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 MMP23AO75900 390 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 OR2J2O76002 312 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 VAMP5O95183 116 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 OPN1LWP04000 364 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 COL9A1P20849 921 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 CD82P27701 267 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 ARL4DP49703 201 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 RPL19P84098 196 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 FOXL1Q12952 345 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 KIAA0895LQ68EN5 471 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 NECAP1Q8NC96 275 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 VAMP8Q9BV40 100 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 STRADBQ9C0K7 418 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 GPR35Q9HC97 309 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 LRRC3CA6NJW4 275 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 SYNGR2O43760 224 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 ANGPTL7O43827 346 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 PDE6DO43924 150 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 NRASP01111 189 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 SERPINA7P05543 415 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 UMODP07911 640 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 ESDP10768 282 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 GZMHP20718 246 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 MDKP21741 143 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 BRS3P32247 399 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 ELLP55199 621 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 ZNF726P1Q15940 193 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 TMEM42Q69YG0 159 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 C20orf196Q8IYI0 205 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 GAPTQ8N292 157 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 OR4B1Q8NGF8 309 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 TXNDC17Q9BRA2 123 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 OR2J1Q9GZK6 312 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 PARLQ9H300 379 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 OR51B6Q9H340 312 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 LPAR2Q9HBW0 351 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 TMEM106BQ9NUM4 274 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 PLEK2Q9NYT0 353 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 PSENENQ9NZ42 101 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 KLRF1Q9NZS2 232 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 TAAR3PQ9P1P4 343 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-215ENST00000537304 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms