RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524296.5

SFI1-228, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 5

Gene SFI1, Length 2,108 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-228	ENST00000524296	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296		H0Y980	276 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	CD59	P13987	128 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	NQO2	P16083	231 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	SPRY4	Q9C004	299 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296		H3BQ15	152 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	HSD17B6	O14756	317 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	CST7	O76096	145 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	GPM6A	P51674	278 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	GFRA1	P56159	465 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	OR8G1	Q15617	311 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	MKX	Q8IYA7	352 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	NEK7	Q8TDX7	302 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	MUCL1	Q96DR8	90 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	ATP5S	Q99766	215 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	NIT2	Q9NQR4	276 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	DEPP	Q9NTK1	212 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296		A0A087WWC5	75 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	SLC34A2	O95436	690 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	TMEM50A	O95807	157 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	IGHV3-9	P01782	118 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	IGHV2-70	P01814	119 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	HBE1	P02100	147 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	IL24	Q13007	206 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	ACER2	Q5QJU3	275 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	CHST1	O43916	411 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	COX5B	P10606	129 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	S100G	P29377	79 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	RAB2A	P61019	212 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	TLE4	Q04727	773 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	ICAM4	Q14773	271 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	HAGH	Q16775	308 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	RAB39B	Q96DA2	213 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	STRADB	Q9C0K7	418 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	CLN5	O75503	358 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	F10	P00742	488 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	JMJD7	P0C870	316 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	SFTPC	P11686	197 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	EPHA1	P21709	976 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	UBE2K	P61086	200 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	ZNF154	Q13106	437 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	SSPN	Q14714	243 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	LINC00596	Q86U02	117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	PSMF1	Q92530	271 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	GPHA2	Q96T91	129 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296		R4GN57	208 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	PINLYP	A6NC86	204 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	DFFB	O76075	338 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	CCNO	P22674	350 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	CYB561	P49447	251 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	RUNX1	Q01196	453 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	ZNF429	Q86V71	674 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	DDA1	Q9BW61	102 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	PLK3	Q9H4B4	646 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFI1-228	ENST00000524296	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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