RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 ATP6V1B2P21281 511 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 CCL1P22362 96 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 FASP25445 335 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ATP6V1E1P36543 226 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 RBP2P50120 134 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 PRKXP51817 358 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ATP1B3P54709 279 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 RPL31P62899 125 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 PAX5Q02548 391 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 PLA2G7Q13093 441 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 PRDX4Q13162 271 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 GPR176Q14439 515 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF273Q14593 569 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 FAM189A2Q15884 450 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 Q3ZCU0 254 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 WDR38Q5JTN6 314 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 LINC01590Q5TEZ4 76 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 CST9LP1Q5W188 147 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 PLCXD3Q63HM9 321 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 CORO6Q6QEF8 472 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 UTS2BQ765I0 119 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 VMO1Q7Z5L0 202 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 NDUFA11Q86Y39 141 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 SLC24A4Q8NFF2 622 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 OR51D1Q8NGF3 324 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ANGPTL6Q8NI99 470 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 THEM6Q8WUY1 208 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 SECTM1Q8WVN6 248 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 FCAMRQ8WWV6 532 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 LHX4Q969G2 390 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 RDH12Q96NR8 316 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 DUX5Q96PT3 197 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 OR8B4Q96RC9 309 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 FEVQ99581 238 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 TEAD3Q99594 435 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 FAM107BQ9H098 131 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 EGLN3Q9H6Z9 239 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 DCLRE1BQ9H816 532 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 SPACA1Q9HBV2 294 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ZFP57Q9NU63 452 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 UFSP2Q9NUQ7 469 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 IMPAD1Q9NX62 359 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 TAS2R3Q9NYW6 316 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 GMPPBQ9Y5P6 360 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 CACNG2Q9Y698 323 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 LINC00312Q9Y6C7 94 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 R4GMQ9 66 aa3.39□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 A0A087WYN8 130 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 MEIOCA2RUB1 952 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM212A6NML5 194 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 E9PQ18 207 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 G3V2T6 193 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 CDIPTO14735 213 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 SH2D1BO14796 132 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 CA11O75493 328 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 FADS2O95864 444 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 IGLV3-1P01715 115 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 GYPAP02724 150 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 HLA-DPB1P04440 258 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 PGA5P0DJD9 388 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF728P0DKX0 622 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 OR5H8P0DN80 308 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 HTR1FP30939 366 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 PYCR1P32322 319 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 CAPZA1P52907 286 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 CRISP1P54107 249 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 PRRX1P54821 245 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 CBX1P83916 185 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF415Q09FC8 603 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 GINS1Q14691 196 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 MPPED2Q15777 294 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 SSX1Q16384 188 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 MEP1BQ16820 701 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 DEFB112Q30KQ8 113 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 SNAI3Q3KNW1 292 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC58Q4VC31 144 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 KLHL12Q53G59 568 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A30Q5SVS4 291 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM42Q69YG0 159 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 PRR27Q6MZM9 219 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ACP7Q6ZNF0 438 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF554Q86TJ5 538 aa3.38□□□□□ -1.87
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF329Q86UD4 541 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms