RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 IL33O95760 270 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 MPIG6BO95866 241 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 TLE1Q04724 770 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 LY6DQ14210 128 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 TSPO2Q5TGU0 170 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 GFRALQ6UXV0 394 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 THRSPQ92748 146 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 TP53RKQ96S44 253 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 GNG13Q9P2W3 67 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 HHLA2Q9UM44 414 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 RNF115Q9Y4L5 304 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 CHD8Q9HCK8 2581 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 MEGF11A6BM72 1044 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 GJE1A6NN92 205 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 H3BML4 177 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 OPN1MWP04001 364 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 SP1P08047 785 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF74Q16587 644 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 MPV17LQ2QL34 196 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM171Q8WVE6 324 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 KLHDC3Q9BQ90 382 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 PCGF1Q9BSM1 259 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 B4DEV8 164 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 H3BMH7 237 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 CMTM1Q8IZ96 169 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 SARAFQ96BY9 339 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 ABHD6Q9BV23 337 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 SPRY4Q9C004 299 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 ZFP92A6NM28 416 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf98E9PRG8 122 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 TNFSF12O43508 249 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 IFNA21P01568 189 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 SNU13P55769 128 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 ARFRP1Q13795 201 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 MMDQ15546 238 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf140Q5VVS0 124 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 CALHM1Q8IU99 346 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 IL22RA2Q969J5 263 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 VSTM2LQ96N03 204 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 MSL2Q9HCI7 577 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 SLC7A11Q9UPY5 501 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 CBY3A6NI87 242 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 CBR3O75828 277 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF117Q03924 483 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 STPG4Q8N801 248 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 Q8NFD4 153 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 NKX6-3A6NJ46 265 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 M0QZ24 198 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 BGLAPP02818 100 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF43P17038 809 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 OR10J1P30954 320 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 SELENOTP62341 195 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 OR10S1Q8NGN2 331 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 OR4C3Q8NH37 302 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 SFTPDP35247 375 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 PSG6Q00889 435 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 EGR4Q05215 589 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 SLC18B1Q6NT16 456 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 GPR35Q9HC97 309 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 G6PC2Q9NQR9 355 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 ANAPC10Q9UM13 185 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 LOC105371242A0A075B767 164 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM14DPA8MWL7 114 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 SLC16A7O60669 478 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 RENP00797 406 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 CCKARP32238 428 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-211ENST00000520276 FAM189A2Q15884 450 aa8.7□□□□□ -1.02
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