RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513420.1

CTBP1-212, Transcript of C-terminal binding protein 1, human

TSL 3

Gene CTBP1, Length 704 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP1-212	ENST00000513420	CCRL2	O00421	344 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	LIMS3	P0CW19	117 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	LIMS4	P0CW20	117 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	GZMH	P20718	246 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	MED21	Q13503	144 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	STX19	Q8N4C7	294 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	APH1B	Q8WW43	257 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	VCX3B	Q9H321	246 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	IL36G	Q9NZH8	169 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	CKLF	Q9UBR5	152 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420		K7EIL1	84 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	DCK	P27707	260 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	REG1B	P48304	166 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	ETV1	P50549	477 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	MPV17L	Q2QL34	196 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	XAF1	Q6GPH4	301 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	ASCL4	Q6XD76	172 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420		Q8NFD4	153 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	ARL11	Q969Q4	196 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	SMIM19	Q96E16	107 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	IFT22	Q9H7X7	185 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	ZFP57	Q9NU63	452 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTBP1-212	ENST00000513420	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	AIP	O00170	330 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	GTF2F2	P13984	249 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	SLC6A1	P30531	599 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	VHL	P40337	213 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	COMMD1	Q8N668	190 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	UBALD1	Q8TB05	177 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	CCDC107	Q8WV48	283 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	NRG4	Q8WWG1	115 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	RDH12	Q96NR8	316 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	RAB9B	Q9NP90	201 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	IGHG2	P01859	326 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	THBS3	P49746	956 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	GPR176	Q14439	515 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	STPG2	Q8N412	459 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	GON7	Q9BXV9	100 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	AP4M1	O00189	453 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	SPINT2	O43291	252 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	ORC5	O43913	435 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	MYCNOS	P40205	109 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	RAB25	P57735	213 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	KRTAP10-11	P60412	298 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420		Q499Y3	187 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	TEX38	Q6PEX7	206 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	LINC00311	Q8N616	119 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	CYGB	Q8WWM9	190 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	ORAI1	Q96D31	301 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	VCX	Q9H320	206 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTBP1-212	ENST00000513420	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55

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