RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 PSMF1Q92530 271 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 IFNA17P01571 189 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 SERPINA7P05543 415 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 DCAF12Q5T6F0 453 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB39BQ96DA2 213 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 MUCL1Q96DR8 90 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 CALHM2Q9HA72 323 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 LRFN1Q9P244 771 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 FBP1P09467 338 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 F2RP25116 425 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 SSPNQ14714 243 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 IL22RA2Q969J5 263 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF727A8MUV8 499 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 HS3ST1O14792 307 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 CEACAM1P13688 526 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 OR5A2Q8NGI9 324 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 WDFY4Q6ZS81 3184 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 ICAM4Q14773 271 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 ATP5SQ99766 215 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A0G2JRQ6 117 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 LINC00587B1AMM8 73 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 H0YL77 283 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 CELA3AP09093 270 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 TLE4Q04727 773 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF488Q96MN9 340 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 SPINK2P20155 84 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 RPS10P46783 165 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 LHX2P50458 406 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 UBE2KP61086 200 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 IL24Q13007 206 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF429Q86V71 674 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 CT55Q8WUE5 264 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM186AA6NE01 2351 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 B4E171 279 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 TXNL1O43396 289 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 CLN5O75503 358 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 TSPAN7P41732 249 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 RDH5Q92781 318 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 OR2W1Q9Y3N9 320 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 WSB1Q9Y6I7 421 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 DOCK10Q96BY6 2186 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 H3BP45 60 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 COX5BP10606 129 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 TAS2R30P59541 319 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 OR10J5Q8NHC4 309 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 CLDND2Q8NHS1 167 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 MMP24Q9Y5R2 645 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 CD300LBA8K4G0 201 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 DLK1P80370 383 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 OR8G1Q15617 311 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF506Q5JVG8 444 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 OR51H1Q8NH63 302 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 GPR146Q96CH1 333 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 HIPK2Q9H2X6 1198 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 PLK3Q9H4B4 646 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 CER1O95813 267 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 S100GP29377 79 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 STX12Q86Y82 276 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 THNSL2Q86YJ6 484 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-221ENST00000511747 FRYQ5TBA9 3013 aa23.08■■□□□ 1.28
SH3BP2-221ENST00000511747 C3orf80F5H4A9 247 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-221ENST00000511747 SERPINE2P07093 398 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-221ENST00000511747 CLDN18P56856 261 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-221ENST00000511747 NCMAPQ5T1S8 102 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-221ENST00000511747 OR5P3Q8WZ94 311 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-221ENST00000511747 POM121L2Q96KW2 1035 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A087WWC5 75 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-221ENST00000511747 TRAV24A0A0B4J272 114 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-221ENST00000511747 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-221ENST00000511747 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-221ENST00000511747 P4HA3Q7Z4N8 544 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1B0GU03 582 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-221ENST00000511747 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-221ENST00000511747 LILRA1O75019 489 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-221ENST00000511747 NEURL1O76050 574 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-221ENST00000511747 PSG2P11465 335 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB2AP61019 212 aa23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms