RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 HSD17B6O14756 317 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 CD69Q07108 199 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 DDI2Q5TDH0 399 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF529Q6P280 563 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 OR2W3Q7Z3T1 314 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 STX19Q8N4C7 294 aa15.24■□□□□ 0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF555Q8NEP9 628 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 ARL11Q969Q4 196 aa15.24■□□□□ 0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 BDKRB2P30411 391 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 TEX38Q6PEX7 206 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 C8orf86Q6ZUL3 223 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 STPG2Q8N412 459 aa15.23■□□□□ 0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 OR2T10Q8NGZ9 312 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 IFT22Q9H7X7 185 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB9BQ9NP90 201 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 IL36GQ9NZH8 169 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 IRGMA1A4Y4 181 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 AP4M1O00189 453 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 GTF2F2P13984 249 aa15.22■□□□□ 0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 REG1BP48304 166 aa15.22■□□□□ 0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF695Q8IW36 515 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC107Q8WV48 283 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC29A1Q99808 456 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa15.21■□□□□ 0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 ORC5O43913 435 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 LIMS3P0CW19 117 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 LIMS4P0CW20 117 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 MYL12AP19105 171 aa15.21■□□□□ 0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 EBI3Q14213 229 aa15.21■□□□□ 0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 SLC22A6Q4U2R8 563 aa15.2■□□□□ 0.02
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SH3BP2-220ENST00000511663 ETV3LQ6ZN32 361 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 LINC00311Q8N616 119 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 C8orf31Q8N9H6 132 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
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SH3BP2-220ENST00000511663 SPACA1Q9HBV2 294 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 GFOD1Q9NXC2 390 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 BABAM2Q9NXR7 383 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 AIPO00170 330 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 SPINT2O43291 252 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 MOSP00540 346 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 CD1BP29016 333 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 ETV1P50549 477 aa15.19■□□□□ 0.02
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SH3BP2-220ENST00000511663 C18orf65Q6ZTR6 163 aa15.19■□□□□ 0.02
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SH3BP2-220ENST00000511663 OR8H1Q8NGG4 311 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 APH1BQ8WW43 257 aa15.19■□□□□ 0.02
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SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
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SH3BP2-220ENST00000511663 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 C15orf65H3BRN8 121 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 CCL24O00175 119 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 OGG1O15527 345 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 TXNL1O43396 289 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 RAMP3O60896 148 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 MT-ND4P03905 459 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 IGHV3-43DP0DP04 118 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 GPR12P47775 334 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 XAF1Q6GPH4 301 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 PQLC1Q8N2U9 271 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 UBALD1Q8TB05 177 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 SMIM19Q96E16 107 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 B9D2Q9BPU9 175 aa15.18■□□□□ 0.02
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