RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276		H3BN98	237 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF254	O75437	659 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	MOS	P00540	346 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	CSN2	P05814	226 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	ROM1	Q03395	351 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	LTC4S	Q16873	150 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	BORCS8	Q96FH0	119 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	HMG20A	Q9NP66	347 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	CALY	Q9NYX4	217 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	PRODH	O43272	600 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF44	P15621	663 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	EPHA2	P29317	976 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	GLP1R	P43220	463 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	SCN1B	Q07699	218 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	GALE	Q14376	348 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM104	Q8NE00	496 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	CYGB	Q8WWM9	190 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	ATP6V0E1	O15342	81 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	CYB5A	P00167	134 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	CD1B	P29016	333 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	CDK5	Q00535	292 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	SETD9	Q8NE22	299 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	RFESD	Q8TAC1	157 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	APOL4	Q9BPW4	351 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	TEX12	Q9BXU0	123 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	COPS3	Q9UNS2	423 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	CXorf65	A6NEN9	183 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	IL1A	P01583	271 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	CCL1	P22362	96 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC2A5	P22732	501 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	HTR1F	P30939	366 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	ATP1B3	P54709	279 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	PMS2P11	Q13670	270 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	GINS1	Q14691	196 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF691	Q5VV52	312 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	C12orf73	Q69YU5	71 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276		Q6P435	159 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	CPO	Q8IVL8	374 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	CHST5	Q9GZS9	411 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276		R4GMQ9	66 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	NUPR2	A6NF83	97 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	HMGN1	P05114	100 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	GNAO1	P09471	354 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	RBP2	P50120	134 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAM53C-208	ENST00000511276	MED21	Q13503	144 aa		10.09	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms