RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 H3BMQ9 156 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM127O75204 238 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 CA11O75493 328 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 SCGNO76038 276 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 MT-ND4P03905 459 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 CD3GP09693 182 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 MMP9P14780 707 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 GNB3P16520 340 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 FPR2P25090 351 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 SSTR5P35346 364 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 TALDO1P37837 337 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 SCAND1P57086 179 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 MOGAT2Q3SYC2 334 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 C6orf183Q5T699 404 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 MZT2AQ6P582 158 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 PNKDQ8N490 385 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM89BQ8N5H3 189 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 Q8N7P7 452 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 RFESDQ8TAC1 157 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 CYYR1Q96J86 154 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 BCL7BQ9BQE9 202 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 SUCNR1Q9BXA5 334 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 PECRQ9BY49 303 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 TAS2R3Q9NYW6 316 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 CALYQ9NYX4 217 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 CUBNO60494 3623 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 MXRA5Q9NR99 2828 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 SPINT2O43291 252 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV1-69P01742 117 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM157CP0CG43 387 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV1-8P0DP01 117 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 PRTN3P24158 256 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 PLAC9Q5JTB6 97 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 UBE2NLQ5JXB2 153 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 IZUMO1Q8IYV9 350 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 DTX3Q8N9I9 347 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 OR13D1Q8NGV5 346 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 ACOT12Q8WYK0 555 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 ARL11Q969Q4 196 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 RAB9BQ9NP90 201 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 C12orf4Q9NQ89 552 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 DIABLOQ9NR28 239 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 HSF4Q9ULV5 492 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 SPATA2Q9UM82 520 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM96BQ9Y3D0 163 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 CEPT1Q9Y6K0 416 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 SESN1Q9Y6P5 492 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV18A0A075B6X5 111 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 C17orf98A8MV24 154 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM25AB3EWG3 89 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM25CB3EWG5 89 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM25GB3EWG6 89 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 RGS5O15539 181 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 RBP4P02753 201 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 ARG1P05089 322 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 GZMHP20718 246 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 DLX6P56179 175 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 LGALS4P56470 323 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 ARL6IP1Q15041 203 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 OLFML2AQ68BL7 652 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 OR52W1Q6IF63 320 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAT1Q6PIZ9 186 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 CORO2AQ92828 525 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC25A38Q96DW6 304 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC6A7Q99884 636 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF69Q9UC07 566 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 MEIOCA2RUB1 952 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 RAB27BO00194 218 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 TOR1AO14656 332 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 NPFFO15130 113 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV3-7P01780 117 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 MNDAP41218 407 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 GNG10P50151 68 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM50BP56557 158 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 GNG2P59768 71 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 PAX5Q02548 391 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 CDNFQ49AH0 187 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM69Q5SWH9 247 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 HEPN1Q6WQI6 88 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 IL1F10Q8WWZ1 152 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms