RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 SIRPAP78324 504 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 DHRS2Q13268 280 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 OR8B8Q15620 311 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 HMGN3Q15651 99 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM162BQ5T6X4 162 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM78Q5T7P6 136 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 FA2HQ7L5A8 372 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 NEGR1Q7Z3B1 354 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 SAXO1Q8IYX7 474 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 OSR2Q8N2R0 312 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 Q8NA96 180 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 OR4N2Q8NGD1 307 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 OR5A2Q8NGI9 324 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ATG5Q9H1Y0 275 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 POPDC3Q9HBV1 291 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD36A6QL64 1941 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 IFITM5A6NNB3 132 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 H0YGG7 62 aa3.93□□□□□ -1.78
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RABGGTB-213ENST00000496055 MPIG6BO95866 241 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 IL2RAP01589 272 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 RAP2AP10114 183 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 GNB3P16520 340 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 USF1P22415 310 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 MANFP55145 182 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
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RABGGTB-213ENST00000496055 GSG1Q2KHT4 349 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ARL9Q6T311 187 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 IGFL2Q6UWQ7 119 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 OR8G5Q8NG78 346 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 OR1J4Q8NGS1 313 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 NEIL3Q8TAT5 605 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 HMGCLL1Q8TB92 370 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ABHD5Q8WTS1 349 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF138Q8WVD3 245 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 OR5P2Q8WZ92 322 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 RND1Q92730 232 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 GGHQ92820 318 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 TIMP4Q99727 224 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 TXNIPQ9H3M7 391 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 AKTIPQ9H8T0 292 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM60AQ9NP50 221 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD10Q9NXR5 420 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 TAC3Q9UHF0 121 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 PRSS50Q9UI38 385 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 VAX2Q9UIW0 290 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 SIGLEC9Q9Y336 463 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 NBASA2RRP1 2371 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 UNC119BA6NIH7 251 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM159BA6NKW6 160 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 F5H5P2 479 aa3.93□□□□□ -1.78
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RABGGTB-213ENST00000496055 MSTNO14793 375 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 SYNGR4O95473 234 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 TRGC2P03986 189 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 IFNW1P05000 195 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 BCKDHAP12694 445 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 CELP19835 753 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP3.93□□□□□ -1.785e-6■■■■□ 20.5
RABGGTB-213ENST00000496055 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 XCR1P46094 333 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP1B3P54709 279 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 GFRA1P56159 465 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ACSM2AQ08AH3 577 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 OR1C1Q15619 314 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 SOHLH1Q5JUK2 328 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ACSM2BQ68CK6 577 aa3.93□□□□□ -1.78
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RABGGTB-213ENST00000496055 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 HECTD1Q9ULT8 2610 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 MSGN1A6NI15 193 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM90A7PA6NKC0 464 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM90A22PA8MWA6 464 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM90A12PA8MX19 464 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 E9PLN8 166 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 MFNGO00587 321 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF195O14628 629 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 C1orf105O95561 183 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 NRASP01111 189 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHG4P01861 327 aa3.92□□□□□ -1.78
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