RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 Q8WTZ3 238 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 FRZBQ92765 325 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SMIM19Q96E16 107 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 LHFPL6Q9Y693 200 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF878C9JN71 531 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CXCL1P09341 107 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 GZMHP20718 246 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 EDNRAP25101 427 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 GNRHRP30968 328 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 LPAR6P43657 344 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 UCP2P55851 309 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PCBD1P61457 104 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 INSL4Q14641 139 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CEACAM16Q2WEN9 425 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 S100A7AQ86SG5 101 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 GJC3Q8NFK1 279 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM18Q96B42 140 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 AMELYQ99218 206 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXB1Q99853 325 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 GTF3C1Q12789 2109 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CACNA1GO43497 2377 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM212A6NML5 194 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 WISP2O76076 250 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 H2BFMP0C1H6 154 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CTSSP25774 331 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CDAP32320 146 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 MMP16P51512 607 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ERVFRD-1P60508 538 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2KP61086 200 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF738Q8NE65 137 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR51F2Q8NH61 342 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF479Q96JC4 524 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 POFUT1Q9H488 388 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PSG11Q9UQ72 335 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 LRP12Q9Y561 859 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 R4GMQ9 66 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SPTBN2O15020 2390 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1B0GW64 132 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TNFSF13O75888 250 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 MMP23AO75900 390 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFB8O95169 186 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CRYGCP07315 174 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CSF1P09603 554 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TIMP3P35625 211 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SNCAP37840 140 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PTH2RP49190 550 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 RBPJQ06330 500 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 MORN2Q502X0 79 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 FBLN7Q53RD9 439 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ARL9Q6T311 187 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 DNM1P46Q6ZS02 220 aa6.23□□□□□ -1.41
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