RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 BOD1L2Q8IYS8 172 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 OR4P4Q8NGL7 312 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 OTUB2Q96DC9 234 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 CMBLQ96DG6 245 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 REEP6Q96HR9 211 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 ASF1BQ9NVP2 202 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF586Q9NXT0 402 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 PRR14LQ5THK1 2151 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 SHANK1Q9Y566 2161 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 ZBED9Q6R2W3 1325 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 STRCQ7RTU9 1775 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 OR5H14A6NHG9 310 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 A8MWP4 228 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 C8orf87E5RJ46 101 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 F5H5K5 113 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL2O95198 593 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 GABRA1P14867 456 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 S100A2P29034 98 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 INPP1P49441 399 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 FAM3AP98173 230 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 ZCWPW2Q504Y3 356 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 LCE3AQ5TA76 89 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 LAIR2Q6ISS4 152 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 MAL2Q969L2 176 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 NAGKQ9UJ70 344 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 MAPKBP1O60336 1514 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 CDK14O94921 469 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 EPPINO95925 133 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 PET100P0DJ07 73 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 PSMB6P28072 239 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 MP68P56378 58 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP10-10P60014 251 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 LYZL2Q7Z4W2 148 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 R4GN34 69 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 SHROOM3Q8TF72 1996 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 CFAP43Q8NDM7 1665 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 ARAP3Q8WWN8 1544 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 NID2Q14112 1375 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 MADDQ8WXG6 1647 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 FANCD2Q9BXW9 1451 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 J3QLI3 93 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 AQP9O43315 295 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 TGFBR2P37173 567 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 FOXA1P55317 472 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 RAB2AP61019 212 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 BAMBIQ13145 260 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 SKP2Q13309 424 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 BCL2A1Q16548 175 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 TIMM23BQ5SRD1 257 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 BCL2L14Q9BZR8 327 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0B4J2C4 111 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 ARGFXA6NJG6 315 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV6-57P01721 117 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 GUSBP08236 651 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 CGB3P0DN86 165 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 CGB7P0DN87 165 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 CRABP2P29373 138 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 GTF2BQ00403 316 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 FAM45BPQ6NSW5 357 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 LFNGQ8NES3 379 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 SPPL2BQ8TCT7 592 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 TVP23CQ96ET8 276 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 H3BMM0 161 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA8RI6L899 631 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 GYPCP04921 128 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 HRES1P13985 223 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 F8A1P23610 371 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 SKP1P63208 163 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 IHHQ14623 411 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 DEFB134Q4QY38 66 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 SPIN3Q5JUX0 258 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF664Q8N3J9 261 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 CMTM2Q8TAZ6 248 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2WQ96B02 151 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM12Q96EX1 92 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 TRIB3Q96RU7 358 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 OR2D2Q9H210 308 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 LRP5O75197 1615 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 IGHMP01871 453 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 PSMD7P51665 324 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC12BQ2HXU8 276 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-212ENST00000491302 NIT1Q86X76 327 aa3.95□□□□□ -1.78
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