RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489390.1

SHOC2-205, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 5

Gene SHOC2, Length 815 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-205	ENST00000489390	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
SHOC2-205	ENST00000489390	UTS2B	Q765I0	119 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SHOC2-205	ENST00000489390	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SHOC2-205	ENST00000489390	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SHOC2-205	ENST00000489390	RFT1	Q96AA3	541 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SHOC2-205	ENST00000489390	TEX12	Q9BXU0	123 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SHOC2-205	ENST00000489390	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SHOC2-205	ENST00000489390	SHISA3	A0PJX4	238 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390		H0YJX3	145 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	SOX15	O60248	233 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	APOL3	O95236	402 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	BRI3	O95415	125 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	KRT8	P05787	483 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	OSM	P13725	252 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	FST	P19883	344 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	RAB40B	Q12829	278 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	TMEM106A	Q96A25	262 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	SPACA5	Q96QH8	159 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	CLN6	Q9NWW5	311 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390		A0A1W2PN81	502 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	NUPR2	A6NF83	97 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	GZMH	P20718	246 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	PRDX6	P30041	224 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	CHRNA7	P36544	502 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	VHL	P40337	213 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	KCNJ3	P48549	501 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF137P	P52743	207 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390		Q3ZCU0	254 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	RDH10	Q8IZV5	341 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	NEK6	Q9HC98	313 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	IGHV3-11	P01762	117 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	ECSCR	Q19T08	205 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	SPATS1	Q496A3	300 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	LCN12	Q6JVE5	192 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	FAHD1	Q6P587	224 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	CST11	Q9H112	138 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	CXorf65	A6NEN9	183 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	MT-ND2	P03891	347 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	OCM2	P0CE71	109 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF20	P17024	532 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	ATP6V1B2	P21281	511 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	ZP3	P21754	424 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	LSAMP	Q13449	338 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	LIN54	Q6MZP7	749 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	SSX6	Q7RTT6	188 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390		Q8N402	240 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	RHOV	Q96L33	236 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	METTL15	A6NJ78	407 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	C15orf65	H3BRN8	121 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	NBR2	O15453	112 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	CNIH1	O95406	144 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	ACTB	P60709	375 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	ELP2	Q6IA86	826 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	FGGY	Q96C11	551 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	MUC4	Q99102	2169 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC31A2	O15432	143 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	DEDD	O75618	318 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	SULT1C4	O75897	302 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	TMEM225B	P0DP42	221 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	NDP	Q00604	133 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	PMS2P11	Q13670	270 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SHOC2-205	ENST00000489390	IL13RA2	Q14627	380 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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