RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	CLDN34	H7C241	214 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	F2RL2	O00254	374 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	MFNG	O00587	321 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	SCGN	O76038	276 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	CDK2	P24941	298 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290		Q3ZCU0	254 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	SPATA2	Q9UM82	520 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	TCF21	O43680	179 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	IGLV1-47	P01700	117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	SSTR5	P35346	364 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	GDNF	P39905	211 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	VEGFC	P49767	419 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	VBP1	P61758	197 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	C6orf183	Q5T699	404 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290		Q6ZPA2	131 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	NEK7	Q8TDX7	302 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	PECR	Q9BY49	303 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	SCOC	Q9UIL1	159 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A0A6YYH2	397 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290		A6NJ64	397 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	SERPINE3	A8MV23	424 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	PAH	P00439	452 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	SAA4	P35542	130 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	TMBIM6	P55061	237 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	ARL6IP1	Q15041	203 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	AANAT	Q16613	207 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	GPR107	Q5VW38	600 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290		Q6YL49	198 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290		Q6ZTK2	550 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	PNKD	Q8N490	385 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM86B	Q8N661	226 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF596	Q8TC21	504 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	JMJD8	Q96S16	334 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB9B	Q9NP90	201 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	ANK2	Q01484	3957 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A0U1RQK1	487 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	UBE2QL1	A1L167	161 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	C12orf77	C9JDV5	145 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	SERPINB10	P48595	397 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	LOXL3	P58215	753 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	HMGN3	Q15651	99 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	IDNK	Q5T6J7	187 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB3C	Q96E17	227 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	ABCG5	Q9H222	651 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	ESM1	Q9NQ30	184 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	AK3	Q9UIJ7	227 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-208	ENST00000487290	FBP1	P09467	338 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-208	ENST00000487290	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		13.45	□□□□□ -0.26

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