RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485939.5

BBX-225, Transcript of BBX, HMG-box containing, human

TSL 4

Gene BBX, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBX-225	ENST00000485939	JTB	O76095	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	CST1	P01037	141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	HMGN1	P05114	100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	CSN2	P05814	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	OR8U8	P0C7N1	319 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	VDAC1	P21796	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	VHL	P40337	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	RBP2	P50120	134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	ATP1B3	P54709	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	ZP1	P60852	638 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	CDC42	P60953	191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	BNIP1	Q12981	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939		Q8IYB0	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	OPALIN	Q96PE5	141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	PARP11	Q9NR21	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	CLN6	Q9NWW5	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	DEGS1	O15121	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	SHOX	O15266	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	BRI3	O95415	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	MOS	P00540	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	IGLV1-40	P01703	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	IGF1	P05019	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	KRT8	P05787	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	SOX6	P35712	828 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	MTNR1B	P49286	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	RAB7A	P51149	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	DAP	P51397	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	INSL3	P51460	131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	ZNF134	P52741	427 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	CRISP1	P54107	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	RUNX1	Q01196	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	ZNF85	Q03923	595 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	TNP2	Q05952	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	CCDC107	Q8WV48	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	FUOM	A2VDF0	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	METTL15	A6NJ78	407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	LINC01619	G3V211	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	MPZL2	O60487	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	SNX3	O60493	162 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	E2F6	O75461	281 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	CYB5A	P00167	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	RAP2A	P10114	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	ARSB	P15848	533 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	ZNF20	P17024	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	RAB9A	P51151	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	ISL1	P61371	349 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	EFNB1	P98172	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	GNMT	Q14749	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	MMD	Q15546	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-225	ENST00000485939	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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