RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 BCL2P10415 239 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 DYNLT3P51808 116 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 LOC105371242A0A075B767 164 aa7.27□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 K7EP13 123 aa7.27□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 GPR75O95800 540 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 HPNP05981 417 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 CTXN2P0C2S0 81 aa7.27□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM187Q14656 261 aa7.27□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.27□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 TSTD1Q8NFU3 115 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5D14Q8NGL3 314 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNG3Q8TAE7 436 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 GPER1Q99527 375 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 Q9N2K0 584 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.27□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM131Q92545 1883 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 SSSCA1O60232 199 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 TTRP02766 147 aa7.26□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 COMMD2Q86X83 199 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 LILRA1O75019 489 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 HRASP01112 189 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 RANP62826 216 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2V1Q13404 147 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 CD226Q15762 336 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 BSXQ3C1V8 233 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 OR8G2PQ6IF36 304 aa7.26□□□□□ -1.25
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