RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428962.2

THBS3-202, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 2

Gene THBS3, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-202ENST00000428962 TUBG2Q9NRH3 451 aa11.64□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 CCL28Q9NRJ3 127 aa11.64□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 F8W036 122 aa11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 PGA5P0DJD9 388 aa11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 MMP9P14780 707 aa11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 COX5AP20674 150 aa11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 ERVK11-1P61568 191 aa11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 OR8G1Q15617 311 aa11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 C10orf91Q5T1B1 145 aa11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 ATRAIDQ6UW56 229 aa11.63□□□□□ -0.55
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THBS3-202ENST00000428962 SLC25A31Q9H0C2 315 aa11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 SPTBN2O15020 2390 aa11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 A0A1W2PR80 420 aa11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 SH2D1BO14796 132 aa11.63□□□□□ -0.55
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THBS3-202ENST00000428962 WNT2P09544 360 aa11.63□□□□□ -0.55
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THBS3-202ENST00000428962 AKR1C2P52895 323 aa11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 VAMP2P63027 116 aa11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 AKR1C1Q04828 323 aa11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 BTNL8Q6UX41 500 aa11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 C20orf204Q6ZNR8 217 aa11.63□□□□□ -0.55
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THBS3-202ENST00000428962 OR2C3Q8N628 320 aa11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 SEC11CQ9BY50 192 aa11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 UQCC1Q9NVA1 299 aa11.63□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 NCOR2Q9Y618 2525 aa11.62□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 ADAM20O43506 726 aa11.62□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 SPP1P10451 314 aa11.62□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 F2RP25116 425 aa11.62□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 ZNF154Q13106 437 aa11.62□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 ZNF266Q14584 549 aa11.62□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 ZNF146Q15072 292 aa11.62□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 NMSQ5H8A3 153 aa11.62□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 ZNF497Q6ZNH5 498 aa11.62□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 COMMD1Q8N668 190 aa11.62□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 OR10V1Q8NGI7 309 aa11.62□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
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THBS3-202ENST00000428962 SHANK1Q9Y566 2161 aa11.61□□□□□ -0.55
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THBS3-202ENST00000428962 TSPAN9O75954 239 aa11.61□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 IGKV3-15P01624 115 aa11.61□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
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THBS3-202ENST00000428962 C11orf1Q9H5F2 150 aa11.61□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa11.61□□□□□ -0.55
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THBS3-202ENST00000428962 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
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THBS3-202ENST00000428962 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
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THBS3-202ENST00000428962 WFDC1Q9HC57 220 aa11.6□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa11.6□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 WRBO00258 174 aa11.6□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 TNFSF12O43508 249 aa11.6□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 CEACAM4O75871 244 aa11.6□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 WT1P19544 449 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
THBS3-202ENST00000428962 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
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