RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC38A6Q8IZM9 456 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 C17orf50Q8WW18 174 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF126Q9BV68 326 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC5A7Q9GZV3 580 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 TUBG2Q9NRH3 451 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 Q9UFV3 132 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 RAXQ9Y2V3 346 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 CACNA1DQ01668 2161 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 ROS1P08922 2347 aa3.36□□□□□ -1.87
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LRRTM4-201ENST00000409088 HSD17B6O14756 317 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
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LRRTM4-201ENST00000409088 CTXN2P0C2S0 81 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.36□□□□□ -1.87
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LRRTM4-201ENST00000409088 WDR82Q6UXN9 313 aa3.36□□□□□ -1.87
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LRRTM4-201ENST00000409088 SLC51BQ86UW2 128 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNRGQ8N5I3 272 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM169BQ8N8A8 192 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.36□□□□□ -1.87
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LRRTM4-201ENST00000409088 WNT10AQ9GZT5 417 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 RHOFQ9HBH0 211 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.36□□□□□ -1.87
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LRRTM4-201ENST00000409088 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 VSTM5A8MXK1 200 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 F5H0A9 414 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
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LRRTM4-201ENST00000409088 TNFSF12O43508 249 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 SPRY3O43610 288 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 PSPNO60542 156 aa3.36□□□□□ -1.87
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LRRTM4-201ENST00000409088 TMPRSS3P57727 454 aa3.36□□□□□ -1.87
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LRRTM4-201ENST00000409088 C1orf174Q8IYL3 243 aa3.36□□□□□ -1.87
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LRRTM4-201ENST00000409088 GALNT11Q8NCW6 608 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 OR10J5Q8NHC4 309 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 GALNT14Q96FL9 552 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 TP53RKQ96S44 253 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 SUCNR1Q9BXA5 334 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 PFDN2Q9UHV9 154 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 GLS2Q9UI32 602 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 MEMO1Q9Y316 297 aa3.36□□□□□ -1.87
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LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.35□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa3.35□□□□□ -1.87
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LRRTM4-201ENST00000409088 MSGN1A6NI15 193 aa3.35□□□□□ -1.87
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LRRTM4-201ENST00000409088 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
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LRRTM4-201ENST00000409088 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
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LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF497Q6ZNH5 498 aa3.35□□□□□ -1.87
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LRRTM4-201ENST00000409088 OR1S1Q8NH92 325 aa3.35□□□□□ -1.87
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LRRTM4-201ENST00000409088 SCARB1Q8WTV0 552 aa3.35□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC29Q8WV35 223 aa3.35□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 ST8SIA2Q92186 375 aa3.35□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 SLX1AQ9BQ83 275 aa3.35□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 IFT22Q9H7X7 185 aa3.35□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa3.35□□□□□ -1.87
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