RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 TOLLIPQ9H0E2 274 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 DYNLRB1Q9NP97 96 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF222Q9UK12 451 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 OR5H14A6NHG9 310 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 K7N7A8 449 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 LGALS8O00214 317 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 WNT9BO14905 357 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 ZG16O60844 167 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF737O75373 536 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 TUSC2O75896 110 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 IGFBP2P18065 325 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 GZMHP20718 246 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 FCGR2CP31995 323 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 HERV-K104P61576 105 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 IL13RA1P78552 427 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 COL10A1Q03692 680 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 FCN2Q15485 313 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 CDSNQ15517 529 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 HMGN3Q15651 99 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 MUC15Q8N387 334 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 ANGPTL6Q8NI99 470 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 MITD1Q8WV92 249 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 MAFIPQ8WZ33 124 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 DYRK2Q92630 601 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 PHB2Q99623 299 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 SEC22CQ9BRL7 303 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 C5orf66Q9H5L9 145 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF69Q9UC07 566 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 OR14J1Q9UGF5 321 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 C9orf170A2RU37 121 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 FAM221AA4D161 298 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 SIAH2O43255 324 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 PSPNO60542 156 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 B3GALNT1O75752 331 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 RGS11O94810 467 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 OR2A4O95047 310 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 SFT2D2O95562 160 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 C1QBP02746 253 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
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POLR1A-202ENST00000409024 PGAM2P15259 253 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 EGR1P18146 543 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 S100GP29377 79 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 OR3A1P47881 315 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 NPY4RP50391 375 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 RAP2BP61225 183 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 RND3P61587 244 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 DHRS2Q13268 280 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 MSMO1Q15800 293 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 ZFP69Q49AA0 526 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 STUMQ69YW2 141 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 LIN54Q6MZP7 749 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZPA2 131 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 C17orf107Q6ZR85 190 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 KCTD9Q7L273 389 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 CD177Q8N6Q3 437 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 OR2AK2Q8NG84 335 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 COQ8AQ8NI60 647 aa8.2□□□□□ -1.1
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POLR1A-202ENST00000409024 OR2A7Q96R45 310 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 SHARPINQ9H0F6 387 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF665Q9H7R5 613 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 CBLN4Q9NTU7 201 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 PPIAL4EA0A075B759 164 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 FAM172BPA6NC97 362 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 NKX6-3A6NJ46 265 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 PPIAL4DF5H284 164 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM178BH3BS89 294 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 HSPB6O14558 160 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 SLC22A5O76082 557 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 PPYP01298 95 aa8.19□□□□□ -1.1
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