RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 FUT9Q9Y231 359 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 K7ESF4 209 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 DHRS3O75911 302 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 HAND1O96004 215 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 HYAL1Q12794 435 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 HLA-DRB5Q30154 266 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 OVCH2Q7RTZ1 564 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 LRRC61Q9BV99 259 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 PRSS50Q9UI38 385 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 TNFSF18Q9UNG2 199 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 P01737 135 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 MYF5P13349 255 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 ID1P41134 155 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 CAMPP49913 170 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 B2MP61769 119 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 ERASQ7Z444 233 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 MFRPQ9BY79 579 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 ISLRO14498 428 aa7.81□□□□□ -1.16
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PTPRM-202ENST00000400053 PGA5P0DJD9 388 aa7.81□□□□□ -1.16
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PTPRM-202ENST00000400053 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
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PTPRM-202ENST00000400053 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 PSG11Q9UQ72 335 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.81□□□□□ -1.16
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PTPRM-202ENST00000400053 CHST1O43916 411 aa7.81□□□□□ -1.16
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PTPRM-202ENST00000400053 PATE4P0C8F1 98 aa7.81□□□□□ -1.16
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PTPRM-202ENST00000400053 Q5BKY6 102 aa7.81□□□□□ -1.16
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PTPRM-202ENST00000400053 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
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PTPRM-202ENST00000400053 MGAT2Q10469 447 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 WBP1LQ9NX94 342 aa7.81□□□□□ -1.16
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PTPRM-202ENST00000400053 COL9A1P20849 921 aa7.8□□□□□ -1.16
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PTPRM-202ENST00000400053 ZNF774Q6NX45 483 aa7.8□□□□□ -1.16
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PTPRM-202ENST00000400053 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 SIRT7Q9NRC8 400 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 ATG2BQ96BY7 2078 aa7.8□□□□□ -1.16
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PTPRM-202ENST00000400053 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 PRNDQ9UKY0 176 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 VSIG4Q9Y279 399 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 C1QL1O75973 258 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 GZMHP20718 246 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 GAMTQ14353 236 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 OR8I2Q8N0Y5 310 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7.8□□□□□ -1.16
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