RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 KLK14Q9P0G3 267 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 NTNG1Q9Y2I2 539 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 M0R2Z0 102 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 LSM8O95777 96 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 PBX2P40425 430 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 RBM11P57052 281 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 CCL14Q16627 93 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf189Q5VU69 101 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10G7Q8NGN6 311 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 KCTD7Q96MP8 289 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 AK3Q9UIJ7 227 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PPV9 198 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TSPAN11A1L157 253 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 C7orf71A4D174 169 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM189A5PLL7 270 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 C2CD4BA6NLJ0 364 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 VWC2LB2RUY7 222 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TIMP1P01033 207 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 MYBPHQ13203 477 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 PSG5Q15238 335 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 GGTA1PQ4G0N0 100 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 C6orf136Q5SQH8 315 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 PP6455Q8WZ26 134 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 RPEQ96AT9 228 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 SMIM19Q96E16 107 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM101Q96IK0 257 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 DCBLD2Q96PD2 775 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 GABRG3Q99928 467 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TM2D2Q9BX73 214 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 GABARAPL3Q9BY60 117 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 METRNQ9UJH8 293 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF114Q9Y508 228 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 SNX11Q9Y5W9 270 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4C46A6NHA9 309 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM90A7PA6NKC0 464 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM90A22PA8MWA6 464 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM90A12PA8MX19 464 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 CLDN5O00501 218 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 OXTP01178 125 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TBC1D28Q2M2D7 210 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 GPD1LQ8N335 351 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAJA3Q96EY1 480 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 DUX3Q96PT4 197 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 GPER1Q99527 375 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 EDA2RQ9HAV5 297 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 HELZP42694 1942 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 MLNRO43193 412 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 PRAF2O60831 178 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 HBZP02008 142 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 GZMMP51124 257 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 RUNX3Q13761 415 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 MUC21Q5SSG8 566 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM37Q8WXS4 190 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 SLAMF6Q96DU3 332 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 PELI1Q96FA3 418 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 ANXA10Q9UJ72 324 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 NUMA1Q14980 2115 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM231BA6NCW3 169 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 RAMP2O60895 175 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 ISG15P05161 165 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 ZXDAP98168 799 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4N5Q8IXE1 308 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB125Q8N687 156 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 IRF7Q92985 503 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 NAT6Q93015 286 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 CLDN23Q96B33 292 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 CDH23Q9H251 3354 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 MPPED1O15442 326 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 IL2RAP01589 272 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 MDH2P40926 338 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-202ENST00000380828 CLRN1P58418 232 aa5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms