RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF665Q9H7R5 613 aa13.45□□□□□ -0.26
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PTPRU-201ENST00000345512 A0A1B0GX30 115 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 ADCYAP1P18509 176 aa13.45□□□□□ -0.26
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PTPRU-201ENST00000345512 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 OR2D2Q9H210 308 aa13.43□□□□□ -0.26
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PTPRU-201ENST00000345512 MPC1Q9Y5U8 109 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 A0A1W2PQM1 296 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF17P17021 662 aa13.42□□□□□ -0.26
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PTPRU-201ENST00000345512 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 GCNT2Q8N0V5 402 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 KCNIP2Q9NS61 270 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 IGSF23A1L1A6 192 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 COLCA2A8K830 154 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 MGST1P10620 155 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 Q8IYB0 196 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 LYZL4Q96KX0 146 aa13.42□□□□□ -0.26
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