RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 PLPPR2Q96GM1 343 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 SHARPINQ9H0F6 387 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 CXXC4Q9H2H0 198 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 BIN3Q9NQY0 253 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 CSMD1Q96PZ7 3565 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 CELSR2Q9HCU4 2923 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1B0GW55 424 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 J3QW42 95 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 DUX4L2P0CJ85 424 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 DUX4L3P0CJ86 424 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 DUX4L4P0CJ87 422 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 DUX4L5P0CJ88 424 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 DUX4L6P0CJ89 424 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 DUX4L7P0CJ90 424 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 SULT1A3P0DMM9 295 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 SULT1A4P0DMN0 295 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 TAS2R60P59551 318 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 PHLDA2Q53GA4 152 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 OR11L1Q8NGX0 322 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 OR2T35Q8NGX2 323 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 DCTN5Q9BTE1 182 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 SPACA1Q9HBV2 294 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 DUX4Q9UBX2 424 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 ANAPC10Q9UM13 185 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 ZP3P21754 424 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 GNLYP22749 145 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 ERVK11-1P61568 191 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 IL13RA1P78552 427 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 AESQ08117 197 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 SP6Q3SY56 376 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 SAXO1Q8IYX7 474 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM230Q96A57 120 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 PKIBQ9C010 78 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 ELOVL5Q9NYP7 299 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 TCAPO15273 167 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 KCNAB3O43448 404 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 ZG16O60844 167 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 ATG12O94817 140 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 SMIM6P0DI80 62 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 RPS2P15880 293 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 SSTR2P30874 369 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 PLA2G5P39877 138 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF81P51508 661 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 HERPUD1Q15011 391 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 ADIPOQQ15848 244 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 CD276Q5ZPR3 534 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 DSCAMO60469 2012 aa9.25□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 HAND1O96004 215 aa9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 IGHV3-13P01766 116 aa9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 IGHV3-7P01780 117 aa9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 GABRA2P47869 451 aa9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 RAG2P55895 527 aa9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 TAS2R46P59540 309 aa9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 EDDM3AQ14507 147 aa9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 VAX1Q5SQQ9 334 aa9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 FGFRL1Q8N441 504 aa9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 DLL4Q9NR61 685 aa9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 MPTX1A8MV57 137 aa9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 SIAH2O43255 324 aa9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 IGHV1-46P01743 117 aa9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 FBP1P09467 338 aa9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 ANXA3P12429 323 aa9.24□□□□□ -0.93
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GGPS1-201ENST00000282841 LTC4SQ16873 150 aa9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 FAM169BQ8N8A8 192 aa9.24□□□□□ -0.93
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GGPS1-201ENST00000282841 OR2AK2Q8NG84 335 aa9.24□□□□□ -0.93
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GGPS1-201ENST00000282841 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 SFT2D1Q8WV19 159 aa9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 KIRREL1Q96J84 757 aa9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 GPR61Q9BZJ8 451 aa9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 PIPOXQ9P0Z9 390 aa9.24□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa9.23□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 C9orf170A2RU37 121 aa9.23□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 TNFSF12O43508 249 aa9.23□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 PRAF2O60831 178 aa9.23□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 ADAP1O75689 374 aa9.23□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 AADACP22760 399 aa9.23□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 OR2B11Q5JQS5 317 aa9.23□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM211Q6ICI0 200 aa9.23□□□□□ -0.93
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