RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000231526.8

TRAPPC13-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC13, Length 2,715 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13-201ENST00000231526 PRDX4Q13162 271 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 C5orf64Q2M2E5 130 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 NKAPLQ5M9Q1 402 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 RTL6Q6ICC9 239 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 OR2T2Q6IF00 324 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 SLC25A26Q70HW3 274 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 SMIM15Q7Z3B0 74 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 FAM90A1Q86YD7 464 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZNF611Q8N823 705 aa4.6□□□□□ -1.67
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TRAPPC13-201ENST00000231526 RAB18Q9NP72 206 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 ING3Q9NXR8 418 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 FAM215AQ9Y5M1 114 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 ABCA4P78363 2273 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 TUBAL3A6NHL2 446 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 CCSO14618 274 aa4.6□□□□□ -1.67
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TRAPPC13-201ENST00000231526 MELTFP08582 738 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 TRAPPC2P0DI81 140 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 TRAPPC2BP0DI82 140 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
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TRAPPC13-201ENST00000231526 HRH1P35367 487 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 RAG2P55895 527 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 TAS2R60P59551 318 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 ERVS71-1P61550 626 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 C6orf201Q7Z4U5 140 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 BPIFB2Q8N4F0 458 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 WBP1Q96G27 269 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 CYYR1Q96J86 154 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZNF75AQ96N20 296 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 OR51J1Q9H342 316 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 ST3GAL6Q9Y274 331 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 CGB1A6NKQ9 187 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZNF732B4DXR9 585 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
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TRAPPC13-201ENST00000231526 NDUFB6O95139 128 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 IGKV1D-12P01611 117 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 IGKV3-15P01624 115 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAPPC13-201ENST00000231526 CA6P23280 308 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAPPC13-201ENST00000231526 PPP1CBP62140 327 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAPPC13-201ENST00000231526 GFRALQ6UXV0 394 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 ASCL4Q6XD76 172 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 OSR2Q8N2R0 312 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 Q8NA96 180 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 TMEM229BQ8NBD8 167 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 PXT1Q8NFP0 134 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 OR1J1Q8NGS3 322 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 FAM57AQ8TBR7 257 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAPPC13-201ENST00000231526 CTDSP1Q9GZU7 261 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZNF222Q9UK12 451 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 A0A0U1RRA0 63 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 C7orf66A4D0T2 115 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 SERPINE3A8MV23 424 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 MFNGO00587 321 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 HSPA12AO43301 675 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 PRAF2O60831 178 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAPPC13-201ENST00000231526 CGAP01215 116 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 HPXP02790 462 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAPPC13-201ENST00000231526 OR3A3P47888 321 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 NPBWR2P48146 333 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 RAB9AP51151 201 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 UCNP55089 124 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 ARL6IP1Q15041 203 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 FCN2Q15485 313 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 ST3GAL2Q16842 350 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 CEACAM21Q3KPI0 293 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 PIGYQ3MUY2 71 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 PXDC1Q5TGL8 231 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 TMEM211Q6ICI0 200 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 TMED4Q7Z7H5 227 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 FBXL14Q8N1E6 418 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 OR4K15Q8NH41 348 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC13-201ENST00000231526 SLC25A40Q8TBP6 338 aa4.59□□□□□ -1.67
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