RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 NAA60Q9H7X0 242 aa8.01□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.01□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 NDRG3Q9UGV2 375 aa8.01□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa8□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 SHISA9B4DS77 424 aa8□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF737O75373 536 aa8□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 OR4A8P0C604 315 aa8□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 PSG2P11465 335 aa8□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 EGR1P18146 543 aa8□□□□□ -1.13
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APOBEC1-201ENST00000229304 SERPINF1P36955 418 aa8□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 RBMXP38159 391 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 OR3A1P47881 315 aa8□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 PIGPP57054 158 aa8□□□□□ -1.13
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APOBEC1-201ENST00000229304 COL10A1Q03692 680 aa8□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 ANKRD55Q3KP44 614 aa8□□□□□ -1.13
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APOBEC1-201ENST00000229304 OR5T2Q8NGG2 359 aa8□□□□□ -1.13
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APOBEC1-201ENST00000229304 SLC2A9Q9NRM0 540 aa8□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 RNF7Q9UBF6 113 aa8□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 OR14J1Q9UGF5 321 aa8□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa8□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa8□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 PRR14LQ5THK1 2151 aa8□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.99□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 OOEPA6NGQ2 149 aa7.99□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 C17orf100A8MU93 164 aa7.99□□□□□ -1.13
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APOBEC1-201ENST00000229304 TNFRSF1AP19438 455 aa7.99□□□□□ -1.13
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APOBEC1-201ENST00000229304 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.99□□□□□ -1.13
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APOBEC1-201ENST00000229304 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 MSMO1Q15800 293 aa7.98□□□□□ -1.13
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APOBEC1-201ENST00000229304 C11orf87Q6NUJ2 197 aa7.98□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.98□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 LGI3Q8N145 548 aa7.98□□□□□ -1.13
APOBEC1-201ENST00000229304 BVESQ8NE79 360 aa7.98□□□□□ -1.13
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