RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 GIPC3Q8TF64 312 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 OPALINQ96PE5 141 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 FEVQ99581 238 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 TUBA4BQ9H853 241 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 NDE1Q9NXR1 346 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 KIF25Q9UIL4 384 aa6.67□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 CCDC182A6NF36 153 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 H0YJX3 145 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 HSPB6O14558 160 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 LY6G6CO95867 125 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 IGLV1-40P01703 118 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 OSMP13725 252 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF20P17024 532 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 SSTR5P35346 364 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 KCNJ3P48549 501 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 RAB9AP51151 201 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 MMDQ15546 238 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 UTS2BQ765I0 119 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM104Q8NE00 496 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 MBOAT4Q96T53 435 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 APOL4Q9BPW4 351 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 PARP11Q9NR21 331 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 FAM118AQ9NWS6 357 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 CLN6Q9NWW5 311 aa6.66□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 C12orf77C9JDV5 145 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 H0Y980 276 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 DEGS1O15121 323 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 ATP6V0E1O15342 81 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 IGLV1-51P01701 117 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 HLA-DRB1P01911 266 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 CSTBP04080 98 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 CGB3P0DN86 165 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 CGB7P0DN87 165 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 ATP6V1B2P21281 511 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 CNTFRP26992 372 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 CDK5Q00535 292 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 PAX5Q02548 391 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 GALEQ14376 348 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 RNLSQ5VYX0 342 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 FAHD1Q6P587 224 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 Q8N1Y9 231 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 LRGUKQ96M69 825 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 CST11Q9H112 138 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 KLK15Q9H2R5 256 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.65□□□□□ -1.34
HLA-B-257ENST00000640094 TNCP24821 2201 aa6.65□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 A0A087WW49 117 aa6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 A0A1W2PPE3 182 aa6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 MAGEA13PA6NCF6 341 aa6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 G3V318 75 aa6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 DBTP11182 482 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 ATF1P18846 271 aa6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 HTR1FP30939 366 aa6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 Q3ZCU0 254 aa6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 LCN12Q6JVE5 192 aa6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 Q6P435 159 aa6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 RDH10Q8IZV5 341 aa6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 LINC00311Q8N616 119 aa6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 RFESDQ8TAC1 157 aa6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 RFT1Q96AA3 541 aa6.64□□□□□ -1.35
HLA-B-257ENST00000640094 TMED9Q9BVK6 235 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms