RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636337.1

SPTAN1-231, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-231	ENST00000636337	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	TCTA	P57738	103 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	NDP	Q00604	133 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	DYRK1A	Q13627	763 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	GUCA2B	Q16661	112 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	DEFB135	Q30KP9	77 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM177	Q53S58	311 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	RDH10	Q8IZV5	341 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	OTULIN	Q96BN8	352 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	C7orf26	Q96N11	449 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337		V9GYS6	101 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	MYCBP2	O75592	4640 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	C16orf90	A8MZG2	172 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337		M0R2N4	97 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	MRAS	O14807	208 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	GSTA4	O15217	222 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	TTR	P02766	147 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRGV3	P03979	118 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	SSTR5	P35346	364 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	IFNGR2	P38484	337 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAHD1	Q6P587	224 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	C7orf34	Q96L11	122 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	CST11	Q9H112	138 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	HMG20A	Q9NP66	347 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	KIF25	Q9UIL4	384 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	APLN	Q9ULZ1	77 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGLL5	B9A064	214 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	HSPB6	O14558	160 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	SHOX	O15266	292 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	CYB5A	P00167	134 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	NPPA	P01160	153 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	IFNG	P01579	166 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF3	P17036	446 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	IL3RA	P26951	378 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	FUT6	P51993	359 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	SMIM11A	P58511	58 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	UBE2V2	Q15819	145 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	ACTBL2	Q562R1	376 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	LIN54	Q6MZP7	749 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q6ZWC4	215 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	HDX	Q7Z353	690 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM162A	Q96A26	154 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	BORCS8	Q96FH0	119 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	RITA1	Q96K30	269 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	IL20	Q9NYY1	176 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	NBR2	O15453	112 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	TXNL1	O43396	289 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	CTRB1	P17538	263 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	CD40LG	P29965	261 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	HCCS	P53701	268 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	ACTB	P60709	375 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	TATDN3	Q17R31	274 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	CHST4	Q8NCG5	386 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		7.28	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms