RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		13.41	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		13.41	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		13.41	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		13.41	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		13.41	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		13.41	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		13.41	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		13.41	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	C16orf95	Q9H693	158 aa		13.41	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	CALY	Q9NYX4	217 aa		13.41	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	DPM3	Q9P2X0	92 aa		13.41	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	GHRL	Q9UBU3	117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		13.4	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	GZMH	P20718	246 aa		13.4	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	BRS3	P32247	399 aa		13.4	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	VHL	P40337	213 aa		13.4	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAM1	Q15629	374 aa		13.4	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		13.4	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		13.4	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		13.4	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		13.4	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM203	Q969S6	136 aa		13.4	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		13.4	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	CST11	Q9H112	138 aa		13.4	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	BANF2	Q9H503	90 aa		13.4	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q9H521	79 aa		13.4	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		13.4	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		13.4	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	TCF19	Q9Y242	345 aa		13.4	□□□□□ -0.26
JMJD1C-211	ENST00000633035	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		13.4	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	MGMT	P16455	207 aa		13.39	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	SRM	P19623	302 aa		13.39	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	CD34	P28906	385 aa		13.39	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	PAX5	Q02548	391 aa		13.39	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	INSL4	Q14641	139 aa		13.39	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	LTC4S	Q16873	150 aa		13.39	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		13.39	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		13.39	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR9G1	Q8NH87	305 aa		13.39	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		13.39	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	RFESD	Q8TAC1	157 aa		13.39	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	PIFO	Q8TCI5	191 aa		13.39	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	PHYHIP	Q92561	330 aa		13.39	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		13.39	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	IL1A	P01583	271 aa		13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBB	P0CG47	229 aa		13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	GDNF	P39905	211 aa		13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIR2DS4	P43632	304 aa		13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	DYNLT3	P51808	116 aa		13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	TPBG	Q13641	420 aa		13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC107	Q8WV48	283 aa		13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIRREL1	Q96J84	757 aa		13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	MGLL	Q99685	303 aa		13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		13.38	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A087X0M5	115 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A1B0GX30	115 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	AIP	O00170	330 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	TIMM23	O14925	209 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARL6IP5	O75915	188 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGLV1-47	P01700	117 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	CGB3	P0DN86	165 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	CGB7	P0DN87	165 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	CPE	P16870	476 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	MNDA	P41218	407 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAP2K4	P45985	399 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	PROK1	P58294	105 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		13.37	□□□□□ -0.27
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27

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