RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629179.1

PNKP-223, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 4

Gene PNKP, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-223	ENST00000629179	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	LINC00596	Q86U02	117 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	UFD1	Q92890	307 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM203	Q969S6	136 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	BANF2	Q9H503	90 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	C16orf95	Q9H693	158 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	RAB26	Q9ULW5	256 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	MEGF11	A6BM72	1044 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	CHST1	O43916	411 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	HTR1D	P28221	377 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	CD34	P28906	385 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	VHL	P40337	213 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	KCNJ3	P48549	501 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	PAX5	Q02548	391 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	TPBG	Q13641	420 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	MPV17L	Q2QL34	196 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM104	Q8NE00	496 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	RFESD	Q8TAC1	157 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	KIRREL1	Q96J84	757 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	CALY	Q9NYX4	217 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PNKP-223	ENST00000629179	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	SC5D	O75845	299 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	IGLV1-47	P01700	117 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	IGHV3-7	P01780	117 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	MGMT	P16455	207 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	SRM	P19623	302 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	PROK1	P58294	105 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	LTC4S	Q16873	150 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF596	Q8TC21	504 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	NEK7	Q8TDX7	302 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	DPM3	Q9P2X0	92 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	TCF19	Q9Y242	345 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179		A0A087X0M5	115 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179		A0A1B0GX30	115 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179		A6NDX4	124 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	TOR1A	O14656	332 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	IL1A	P01583	271 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	UCHL1	P09936	223 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	CPE	P16870	476 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	SSTR5	P35346	364 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	PRRX1	P54821	245 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	CCDC107	Q8WV48	283 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	PHYHIP	Q92561	330 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	LEAP2	Q969E1	77 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	FAM46B	Q96A09	425 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	CYYR1	Q96J86	154 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	MGLL	Q99685	303 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	CITED1	Q99966	193 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	RAB18	Q9NP72	206 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	LEUTX	A8MZ59	168 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	F2RL2	O00254	374 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	MT-ND4	P03905	459 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	GABRA5	P31644	462 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	DYNLT3	P51808	116 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	OR10K2	Q6IF99	312 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	RAB12	Q6IQ22	244 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	UBALD1	Q8TB05	177 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179		Q96M66	194 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PNKP-223	ENST00000629179	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58

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