RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC107	Q8WV48	283 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	LGALS12	Q96DT0	336 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	RAX2	Q96IS3	184 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	PRR25	Q96S07	402 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	ASCL2	Q99929	193 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	ALG8	Q9BVK2	526 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	ING4	Q9UNL4	249 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	GABRP	O00591	440 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	SULT1B1	O43704	296 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	ZFPL1	O95159	310 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	CDRT1	O95170	752 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	MTNR1B	P49286	362 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	DGCR2	P98153	550 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF695	Q8IW36	515 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	STPG2	Q8N412	459 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	P2RX4	Q99571	388 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	CCL24	O00175	119 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	IL1A	P01583	271 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	FCGR1A	P12314	374 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	SLC35B1	P78383	322 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	RSU1	Q15404	277 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	ORAI1	Q96D31	301 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	ZFP57	Q9NU63	452 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	DHDH	Q9UQ10	334 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078		H0YHG0	523 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	CCRL2	O00421	344 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	EI24	O14681	340 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	HSD17B6	O14756	317 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	IGHG2	P01859	326 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	ECI1	P42126	302 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	RAB7A	P51149	207 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	GALE	Q14376	348 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	RHOF	Q9HBH0	211 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	MAGEB3	O15480	346 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	FGF16	O43320	207 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	ALPL	P05186	524 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	RAB3A	P20336	220 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	GPR12	P47775	334 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	ELP2	Q6IA86	826 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	TEX38	Q6PEX7	206 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	OR8H3	Q8N146	312 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078		Q8N9W7	124 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	ARL11	Q969Q4	196 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1W2PP11	408 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	SLC31A2	O15432	143 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	SERPINA2	P20848	420 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	GPR50	Q13585	617 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	XAF1	Q6GPH4	301 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	PXT1	Q8NFP0	134 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TCF4-262	ENST00000628078	NEK7	Q8TDX7	302 aa		10.59	□□□□□ -0.71

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